三维构型图的创建-Chem 3D 使用章永凡1. 分子构型的三维描述方法 直角坐标系方法C 0.7 0.0 0.0C -0.7 0.0 0.0H 0.87 0.5 0.0H -0.87 0.5 0.0H -0.87 -0.5 0.0H 0.87 -0.5 0.0 内坐标(z-matrix) 方法 内坐标与直角坐标之间的区别在于，它侧重于从原子之间 的键连角度来描述原子间的相对位置，具体参数包括： 键长：两个原子间的距离( 需用两个原子描述) 键角：确定二根键之间的夹角( 需用三个原子描述) 二面角：确定四个原子所在的两个平面之间的夹角 ( 需用四个原子描述)内坐标的输入格式为： 原子1,原子2,键长,原子3,键角,原子4,二面角1234键长键角二面角C C1 23456CC 1 1.3H 1 1.0 2 120.0H 1 1.0 2 120.0 3 180.0H 2 1.0 1 120.0 3 0.0H 2 1.0 1 120.0 3 180.0在同侧共面对同一构型，内坐标的表示并不唯一C C2 41356HC,1,1.0H,2,1.0,1,120.0C,2,1.3,1,120.0,3
