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生物信息学序列分析ppt课件.ppt

第7章 序列分析2一、初级序列分析一、初级序列分析序列的组成序列的组成/分子量分子量/等电点分析等电点分析碱基组成 DNA序列一个显而易见的特征是四种碱基类型的分布。尽管四种碱基的频率相等时对数学模型的建立可能是方便的,但几乎所有的研究都证明碱基是以不同频率分布的。 表1包含了9个完整DNA分子序列的资料,表2的数据来自两个胎儿球蛋白基因(Gr和Ar),每个基因具有三个外显子和两个内含子(shen等1981)。这两个例子说明序列内和序列间碱基具有不同的频率。在基因每一侧的500 个任意碱基区域被称为“侧翼”,基因间区域是指两个基因间的其余序列。 表1 九种完整DNA序列的碱基组成 表2 人类胎儿球蛋白基因不同区段的碱基组成 78序列组成分析9A/G/C/T的组成,尤其是G+C含量的预测(进化?探针设计?)1011序列组成分析12序列组成分析13蛋白分子量和等电点14蛋白分子量和等电点15蛋白分子量和等电点16蛋白质分子量/等电点预测 online Compute pI/MWhttp:/us.expasy.org/tools/pi_tool.html17酶切位点分析酶切位点分析 只要进行

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