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药物分子对接软件药物分子对接软件元科阳 药物化学张丽燕 有机化学分子模拟与计算化学课程作业简介与操作药物分子与受体结合示意图药物分子与受体作用力示意图三个分子对接软件简介Scripps 研究所的Olson 实验室开发, AutoGrid 和 AutoDock 两个程序组成。其中 AutoGrid 主要负责格点中相关能量的计算,而 AutoDock 则负责构象搜索及评价。 Autodock:LedockDiscovery Studio瑞士苏黎世大学(University of Zurich ),Zhao Hongtao 博士开发的跨平台(Win,Linux, Mac OS) 分子对接软件 主要功能包括:蛋白质的表征(包括蛋白- 蛋白相互作用)、同源建模、分子力学计算和分子动力学模拟、基于结构药物设计工具(包括配体- 蛋白质相互作用、全新药物设计和分子对接)、基于小分子的药物设计工具(包括定量构效关系、药效团、数据库筛选、ADMET )和组合库的设计与分析等研究。三种对接方式1) 刚性对接: 分子构像不发生变化,仅改变分子的空间位置与姿态,简化程度最高,计算量相对较小,适于大分子之间的对接

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