关于分子动力学模拟的 初步认识摸金校尉主要内容 分子动力学模拟概述 MD模拟所需条件 势函数与系综牛顿运动方程及其求解一、分子动力学模拟概述为什么要搞MD模拟Chemistry is no longer a purely experimental science.实验方法无法获得过程中粒子微观细节，成本高等计算机模拟指导定义分子动力学模拟（Molecular Dynamics Simulation）：通过计算机对原子核和电子所构成的多体体系中的微观粒子之间相互作用和运动进行模拟，把每一原子核视为在全部其他的原子核和电子所构成的经验势场的作用下按照牛顿定律进行运动，进而得到体系中粒子的运动轨迹，再按照统计物理的方法计算得出物质的结构和性质等宏观性能。任务：通过求解经典牛顿运动方程，计算一个经典多 体体系的平衡和非平衡性质系统描述：粒子坐标x，速度（动量）v，受力f，时间t模拟体系大小：几百到上百万个粒子，对应于几个到几十个nm。MD模拟的一般过程构建构型构建构型动力学过程模拟动力学过程模拟构型性能计算构型性能计算结果分析结果分析势函数系综初始条件周期性边界条件所需条件MS构建晶胞RDF,
