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第二讲 基因组序列诠释问题n 基因组序列所包含的全部遗传信息是什么？n 基因组作为一个整体如何行使其功能？n 用什么方法寻找基因，研究基因地功能呢？1. 寻找基因1.1 根据开放读码框预测基因A 起始密码子 ATGn 第一个ATG 的确定( 依据Kozak 规则); Kozak 规则是基于已知数据的统计结果. 所谓Kozak 规则，即第一个ATG 侧翼序列的碱基分布所满足的统计规律.Kozak 规则: 若将第一个ATG 中的碱基A ，T ，G 分别标为1,2，3位，则Kozak 规则可描述如下：(1) 第4位的偏好碱基为G ；(2)ATG 的5端约15bp范围的侧翼序列内不含碱基T ；(3) 在-3 ，-6 和-9 位置，G 是偏好碱基；(4) 除-3 ，-6 和-9 位，在整个侧翼序列区，C 是偏好碱基。B 信号肽分析 信号肽分析软件(SignalP http:/www.cbs.dtu.dk/services/signalP ) 把预测过程中证实含完整mRNA 5 端的序列翻译为蛋白序列; 然后用SignalP 软件对前50个氨基酸序列( 从第一个ATG 对应的甲硫氨酸Met 开始)
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