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精选优质文档-倾情为你奉上一、原理转录从基因的启动子区开始,由一系列的转录因子结合到基因的启动子区,通用转录因子结合在基本启动子区起始转录,而这个过程对基因的转录是必需的,但不是充分的,通常需要一些特异的转录因子结合在上游调节序列,使基因特异表达并维持的合适水平,ChIP主要用于研究转录因子(个人认为主要是特异转录因子的作用,因为这些因子的表达才有时空特异性)与下游基因的结合,如果ChIP发现转录因子能与目的基因结合,那么这说明该基因可能是其下游基因,要想进一步证明,还要做高低表达和荧光素酶等实验。二、目的基因的筛选1,如果做ChIP-seq那就不需要在实验前筛选目的基因了,理论上芯片会分析出样本中该转录因子所有的下游基因,我们根据这个分析结果进行筛选就可以了。2、如果是做普通的ChIP,那么在实验前要进行初步的筛选,选择自己感兴趣的目的基因,设计PCR引物,进行验证,所以,这样考虑的话,ChIP实验是对你的早期数据的验证。个人认为,筛选目的基因的方法有一下几种:a,查文献,看转录因子和哪些基因在表达时间,空间,及功能相关。
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