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1. 基因家族(Genefamily)又叫多基因家族(Multigenefamily),系指同一生物体中，从同一祖先基因经过复制、突变而来的一组具有相似的核苷酸序列结构、相似产物、相似功能的基因群体。从广义上讲，同一基因家族的各个成员也可看作是重复基因。但两者相比，基因家族不同成员之间的序列差异毕竟要比重复序列的大一些，也就是说序列一致性程度还是较低一些。2. 基因簇(Genecluster)系指原核生物基因组中，由不同的或相关的一组相邻基因组成的一种特殊的排列组合方式。3. 基因家族与基因簇二者的区别属于同一多基因家族的各个成员，可以存在于不同的染色体上，也可以是存在于同一条染色体上。同一基因家族成员的判断标准：a.多重性；b.紧密的连锁性；c.核苷酸序列同源性；d.相关的表型与功能。基因簇的特点：a. 同一基因簇的不同成员，在遗传上往往是紧密连锁的；b. 同一基因簇的不同成员，可以是同属于同一个操纵子的不同结构基因，也可以是属于不同操纵子的不同结构基因。c. 同一基因簇的不同成员，可以是来自同一基因家族的不同成员，也可以是来自不同基因家族的不同成员。
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