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打开ClustalX进行完全比对由于后面无法用aln 格式转化的meg 格式打开，所以此改用fasta 格式保存并命名为cob2选择此项可打开比对过的文件选择邻接法（NJ 法）构建系统发育树设置Bootstrap 值为100设置Gap 处理为两两删除设置模型为Kimura-2-Parameter此为原始的树此为经过Bootstrap 计算的树并选择左边图标Place Root on Branch选择NC 006081 为外群此为树根，即所有物种最近共同祖先外群树上的数字代表自展支持率，支持率越高就代表属于这一支的可能性越高，图上属于同一支的即代表在进化上相对较近。选择最大简约法（MP法）构建系统发育树设置Bootstrap 值为100此为原始的树此为经过Bootstrap 计算的树并选择左边图标Place Root on Branch 选择NC 006081作为外群此为树根外群树上的数字代表自展支持率，支持率越高就代表属于这一支的可能性越高，图上属于同一支的即代表在进化上相对较近。 对比NJ 法和MP法做出来的树，NJ 法的自展支持率相对较高，且两树中个别序列的位置也不同。 以同样的方
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