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质粒目的基因插入及引物设计流程课件.ppt

一.寻找目的基因mRNA序列及CDS阅读框(蛋白质对应的基因序列)1.选中CDS开发阅读框(表达蛋白的序列)基因序列,共162个碱基;2.注意CDS特征,前段非编码区如果太长,需要增加保护序列;后端非编码区如果长,则说明CDS序列稳定可用;将查到的CDS序列粘贴至new DNA file框中,选择linear类型DNA,软件即可自动分析该段序列中的可能酶切位点二.登录http:/ 前的序列插入目的基因序列,并选择features给插入的目的基因命名UGT1A1在目的基因的终止密码子TGA前还需再加上HA tag标签(阳性对照蛋白,即质粒转染并成功表达的话,该段蛋白必定存在,可用WB测出),标签序列登录addgene官网查询:https:/www.addgene.org/mol-bio-reference/genetic-code/三.克隆引物设计1.电脑设计:回到NCBI的primer blast,拷贝目的基因CDS序列(共1602个碱基),在框中输入|a|和CDS序列,并在Min 和Max分别输入1602(表示blast CDS全部基因);2.手工设计:遵循GC尽量少,Tm尽量小的原

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