第五章 分子系统发育分析q5.1 分子进化的基本概念q5.2 分子进化模型与序列分歧度计算q5.3 分子系统树的构建q5.4 分子系统树的检验q5.5 分子系统发育分析软件及应用5.1 分子进化的基本概念q系统发生（phylogeny）是指生物形成或进化的历史q系统发生学(phylogenetics)研究物种之间的进化关系 q系统发生树（phylogenetic tree）表示形式，描述物种之间进化关系 5.1 分子进化的基本概念q同源性与相似性q关于现代人起源的研究:线粒体DNA所有现代人都是一个非洲女性的后代分类单元分类单元（物种或序列）（物种或序列）物种之间的进化关系物种之间的进化关系 有根树与无根树有根树的数目A B CA B CA B CA B CDDDDDDDDDD无根树的数目A AB BC CA AB BC CD DD DD DNumber of TaxaNumber of unrooted trees Number of rooted trees 31343155151056105945794510395 810395 135135 9135135 2027025 10
