1、生长曲线拟合及细胞群体倍增时间的简化计算作者:严泉剑 李六金 张宇梅 杨贵忠 刘海军 郭金龙 王禾 邵国兴 【关键词】 曲线拟合 关键词: 细胞培养;曲线拟合;细胞群体倍增时间 0 引言 目前细胞群体倍增时间的计算方法有两种,而我们基于计数法绘制细胞生长曲线所获数据,利用 SPSS 软件进行理论推导而得的理论倍增时间计算方法计算相对简单实用,现介绍如下. 1 材料和方法 指数函数拟合模型(Exponential)中,Y=b0 2b1 t 要比 Y=b0 eb1 t 更符合细胞的生物学特性,因为细胞增殖为二分裂生长.Y=b 0 2b1 t 在 SPSS 的曲线模拟功能选项中并没有此函数拟合模型,
2、故将原始数据的自变量时间变量作一转换,即将原自变量乘以 ln2 即可,理论依据为 Y=b0 2b1 t =b0 eb1 tln2 =b0 eb1 (tln2) .依据此列变量进行曲线拟合,记录相应复相关指数及 b0 ,b1 值.细胞倍增时间定义是在生长曲线上细胞数量增加一倍的时间,可以从曲线上换算出,细胞倍增的时间区间即为对数生长期,细胞传代实验多在此区间进行,细胞群体倍增时间的计算方法有两种:做图法 在细胞生长曲线的对数生长期找出细胞增加一倍所需的时间,即倍增时间,公式法,按细胞倍增时间计算细胞群体倍培时间,其公式为:Td =tLg2/(LgNt -LgN0 ) ,计算比较复杂,而我们基于上
3、述曲线进行理论推导而行的理论倍增时间,计算相对简单,首先我们定义 Td 为倍增时间,t 为计数间隔天数,Nt 为对数生长期任一点的理论观察值,N0 为对数生长期理论初始值,推算结果为 Td =24h/b1 ,以下为推导过程. Td=t24hLg2/(LgNt -LgN0 )=t24hLg2/(Lg(b0 eb1tln2 )-Lg(b0 eb1t0ln2 ) ) =t24hLg2/Lg(b0 2b1t )-Lg(b0 2b1t0 ) =t24hLg2/b1 (t-t0 )Lg2 =t24hLg2/b1 tLg2 =24h/b1 2 结果 原始数据、相关转换、理论估测值及各自残差符合实验要求.基于
4、全部数据用指数函数拟合模型(Exponential)拟合的曲线的复相关指数 R 2 (Rsq)为 0.989,b0 为 0.8421,b1 为 0.5929,故其 Td =24h/b1 =40.48h.基于对数生长期数据用指数函数拟合模型(Exponential)拟合的曲线的复相关指数 R2 (Rsq)为 0.989, b0 为 2.3141,b1 为0.9206,故其 Td =24h/b1 =26.07h. 3 讨论 由于细胞生长曲线的散点图用 LOWNESS 法模拟的曲线类似“S”形,故基于全部数据的曲线拟合模型既使拟合优度比较好,Td 值受区间两侧数值的影响亦较大,这由结果 2 和 3
5、比较可以清楚看出.根据细胞倍增的时间区间为对数生长期,因而用基于全部数据拟合的曲线去计算 Td,Td值要受区间外数值的影响,其真实性受到影响.所以我们仅对对数生长期数值进行曲线拟合,拟合优度更好,其中以 Y=b0 2b1t 要比 Y=b0 e b1t 更符合细胞的生物学特性,因为细胞增殖为二分裂生长.而基于此模型得出的 Td=24h/b1 计算方法更简单,可信度更高.所以我们上述所用方法是目前计算的较为简便有效的方法,实际应用中比较顺手1,2 . 致 谢 第四军医大学吴军正、司徒镇强、徐勇勇教授及西安交通大学数学系李开泰、李红俊教授的指教. 参考文献: 1严泉剑,张 菊,闫小君,段 杰,张宇梅,赵锦荣,苏成芝.HPV 感染阳性角朊细胞的原代培养及生物学特性研究J.第四军医大学学报,2001;22(2):171-173. 2严泉剑,张 菊,闫小君,段 杰,赵锦荣,张宇梅,苏成芝.树突细胞免疫对 HPV 感染阳性角朊细胞生物学特性影响J.第四军医大学学报,2001;22(8):684-686.