医学科研数据挖掘方法数据分析思路的构建与实例,.ppt

1、,数据分析思路的构建与实例,北京大学医学部流行病学与卫生统计学系 陈大方 博士/教授/博士生导师电话：+(010)82802644/18600659288 邮箱：,不怕做不到，就怕想不到,如何基于数据挖掘产生文章思路？,观察结局(因变量)研究因素(自变量)混杂因素(协变量）连续变量、分类变量（二分类，等级变量、无序变量）环境因素、临床指标、遗传易感性(基因多态性),思考点从研究变量之间关系角度思考从研究对象构成的角度思考从研究的时间角度思考从以上两个或以上思考,芳香烃有机溶剂暴露对女性生殖结局的影响研究(NIH Project 19962000),数据挖掘实例,课题研究背景 芳香烃类有机溶剂在

2、环境中普遍存在，是一种潜在的生殖毒物，主要包括苯、甲苯、二甲苯、苯乙稀等。它在高浓度下对健康所产生的危害已为国内外较多研究所证实。但是，女性长期暴露于低浓度芳香烃有机溶剂对生殖结局的影响研究报道较少。,研究目的了解石油石化工冶炼厂女工芳香烃有机溶剂等职业有害因素的暴露情况。探讨职业、环境因素暴露，遗传易感性与女性生殖结局的关系。,问卷调查临床体检,新婚体检,停止避孕,分娩,妊娠,新婚随访,新婚日记每日晨尿,暴露评价,孕期随访问卷调查,出生记录,生活习惯,一般健康状况,疾病史,膳食营养,月经情况,家庭居住,血清营养,暴露评价,-hcg检测,遗传易感性,早孕随访,中孕随访,基线随访,分娩住院记录,

3、研究内容,I相代谢酶基因和II相代谢酶基因，共12个基因多态性位点,职业情况膳食营养月经情况家庭居住情况其他,血红蛋白铁维生素B6维生素B12叶酸铁蛋白转铁蛋白受体同型半胱氨酸,监测车间内芳香烃有机溶剂浓度个体主动采样泵采样暴露评价问卷上班时活动情况,2.研究对象 (记录)1600对在燕山石化工作的新婚体检对象：芳香烃有机溶剂暴露组800对非暴露组800对,3. 研究设计 (时间)前瞻性队列研究设计（新婚体检-临床分娩或一年）,文章思路构建步骤,观察结局,一般人口学特征，如年龄、性别、职业疾病史芳香烃有机溶剂暴露，如笨、二甲苯等职业因素，如倒班、噪声、工作体位生活行为，如吸烟、饮酒等膳食营养体

4、格检查，如身高、体重、血压临床生化检查：如肝肾功能血清营养素，如维生素B6，B12，叶酸、铁蛋白，转铁蛋白受体尿液检测，如-hcg遗传易感性，如CYP、GST,研究因素/混杂,出生结局，如出生体重、孕周 受孕时间早早孕丢失临床怀孕 月经功能，如月经周期、痛经,一般人口学特征，如年龄、性别、职业疾病史芳香烃有机溶剂暴露，如笨、二甲苯等职业因素，如倒班、噪声、工作体位生活行为，如吸烟、饮酒等膳食营养体格检查，如身高、体重、血压临床生化检查：如肝肾功能血清营养素，如维生素B6，B12，叶酸、铁蛋白，转铁蛋白受体尿液检测，如-hcg遗传易感性，如CYP、GST,出生结局，如出生体重、孕周 受孕时间早早

5、孕丢失临床怀孕 月经功能，如月经周期、痛经,数据预处理数据描述单因素分析,孕妇混苯化合物暴露对胎儿生长发育的影响。被动吸烟对女性月经功能影响研究。北京某石油化工厂女工苯的内暴露研究。芳香烃和母亲某些代谢酶基因多态性对新生儿出生身长的影响微粒体环氧化酶与谷胱甘肽S转移酶的遗传多态性对新生儿出生体重的影响.早孕期低浓度苯系物暴露对胎儿身长的影响。低浓度混苯对女工生殖激素分泌的影响。新生儿PON2基因多态性与早产的关系。 轮班作业女工排卵日前后的夜班次数对妊娠结局的影响。工效学因素对妇女临床受孕时间影响的研究。以尿激素标记物探讨职业噪声暴露与纺织女工月经功能的关系。,结果是文章的核心结果的顺序绝不是

6、按获得数据的先后排列，而是要按企图说明问题的逻辑顺序排列；不要罗列结果，要分析，结果之间要有逻辑联系；,P5,被动吸烟,受孕时间,早早孕丢失,有机溶剂暴露,孕前营养,身高体重指数,职业因素暴露,临床怀孕,遗传易感性,早产,月经周期,痛经,出生体重,新生儿身长、头围胎儿宫内生长发育迟缓旁氏指数,P12,被动吸烟,受孕时间,早早孕丢失,有机溶剂暴露,孕前营养,身高体重指数,职业因素暴露,临床怀孕,遗传易感性,早产,月经周期,痛经,出生体重,新生儿身长、头围胎儿宫内生长发育迟缓旁氏指数,P4,P15,p13,P5,P12,P14,陈大方,刘彤杉,王黎华,黄因敏,赵一鸣,徐希平. 孕妇混苯化合物暴露对

7、胎儿生长发育的影响J. 疾病控制杂志,1997,04:263-266.陈大方,刘彤杉,杨萍,王黎华,黄因敏,赵一鸣,徐希平. 环境与职业因素对胎儿生长发育的影响J. 环境与健康杂志,1998,03:6-8.潘小川,丁辉,韩丽力,王黎华,徐希平. 被动吸烟对女性月经功能影响研究J. 卫生研究,1999,01:25-27.朱兰,潘小川,昊昆昱,池频频,王黎华,徐希平. 北京某石油化工厂女工苯的内暴露研究J. 中国公共卫生,1999,10:53-54.陈大方,王晓斌,王朝曦,王黎华,徐希平. 芳香烃和母亲某些代谢酶基因多态性对新生儿出生身长的影响J. 北京医科大学学报,2000,05:450-454

8、.陈大方,王朝曦,王晓斌,王黎华,徐希平. 微粒体环氧化酶与谷胱甘肽S转移酶的遗传多态性对新生儿出生体重的影响J. 环境与健康杂志,2000,03:131-134.陈大方,赵一鸣,臧桐华,王黎华,徐希平. 早孕期低浓度苯系物暴露对胎儿身长的影响J. 疾病控制杂志,2000,02:120-122.陈大方,王晓斌,吴迪,王黎华,徐希平. 细胞色素P450氧化酶MSP1基因对有机溶剂的易感性与新生儿出生体重的影响J. 环境与健康杂志,2001,04:208-211.,发表在中华核心期刊文章,陈海燕,王心如,徐莉春,Lasley BL,Overstreet JW,戴建国,张绮,邢厚恂,杜冰,徐希平.

9、低浓度混苯对女工生殖激素分泌的影响J. 中华预防医学杂志,2001,02:12-15.王守林,陈宇炼,陈海燕,徐莉春,曹晋柱,杜冰,王顶贤,施爱民,徐希平,王心如. 某石化企业和化纤企业女工不良妊娠结局的危险因素分析J. 工业卫生与职业病,2001,03:140-143.梁红业,吴白燕,陈大方,陈栎,徐希平,杨帆,胡海燕. 新生儿PON2基因多态性与早产的关系J. 遗传,2002,05:515-518.李佩芝,方自国,潘小川,王黎华,徐希平. 轮班作业女工排卵日前后的夜班次数对妊娠结局的影响J. 中华劳动卫生职业病杂志,2002,05:52-54.吴白燕,梁红业,陈大方,刘林,杨帆,胡海燕,陈

10、栎,王桂香,徐希平. 新生儿CYP2E1基因5端Rsa位点多态性和PON2基因148位点多态性与早产的关系J. 遗传学报,2003,06:577-583.游良雅,潘小川,陈大方,张金良,黄因敏,徐希平,夏桂芳. 苯系混合物对新婚女工生育功能的影响J. 中国公共卫生,2003,07:109-110.倪佳桐,黄爱群,杨帆,刘学,徐希平. 工效学因素对妇女临床受孕时间影响的研究J. 疾病控制杂志,2003,05:420-422.李佩芝,潘小川,徐希平,王黎华. 以尿激素标记物探讨职业噪声暴露与纺织女工月经功能的关系J. 工业卫生与职业病,2004,03:130-135.,Li S, Fang K,

11、Wang W, Hu Y, Chen D. Gene-environment Interaction among GSTT1, PON2 Polymorphisms and Organic Solvents on Gestational Age in a Chinese Women Cohort. Journal of Assisted Reproduction and Genetics. 2014.31(7):881-888.Ting Wu, Yonghua Hu, Changzhong Chen,Fan Yang, Zhiping Li, Zhian Fang, Lihua Wang, D

12、afang Chen. Passive smoking, metabolic gene polymorphism and infant birth weight in a prospective cohort of Chinese women. Am J Epidemiol 2007: 166(3):313-322.Xueying Qin, Yiqun Wu, Changzhong Chen, Fan Yang, Zhiping Li, Zhian Fang, Lihua Wang, Yonghua Hu, Dafang Chen. Low organic solvent exposure a

13、nd combined maternal-infant gene polymorphisms affect gestational age. Occupational and Environmental Medicine, 2008;65(7):482-487.Na Li, Hong Liu, Yonghua Hu, Changzhong Chen,Fan Yang, Zhiping Li, Zhian Fang, Lihua Wang, Dafang Chen. CYP1A1 gene polymorphisms in modifying association between Passiv

14、e smoking and primary dysmenorrheal. Annals of Epidemiology. 2007：17（11）：882-888.,发表在SCI期刊文章,Xiaobin Wang, Dafang Chen et al, Genetic Susceptibility to Benzene and Shortened Gestation: Evidence of Gene-Environment Interaction. American Journal of Epidemicology 2000;152(8):693-700. Dafang Chen, Xiaob

15、in Wang, Changzhong Chen, et al. Exposure to benzene, occupational stress, and reduced birth weight. Occup Environ Med. 2000;57(10):661-667.Alayne G. R., Goldman M.B., Dafang Chen, et al. Preconception homocysteine and B-vitamin status and birth outcomes in Chinese women. American Journal of Clinica

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17、 Is Associated with Birth Outcome in a Prospective Cohort of Chinese Women. J. Nutr. 2003; 133:3449-3455.Wang X, Chen C, Wang L, Chen D, et al. Conception, Early Pregnancy Loss, and Time to Clinical Pregnancy: A Population-Based Study. Fertility 79(3):577-584.,Ha E, Cho SI, Park H, Chen D et al. Doe

18、s standing at work during pregnancy result in reduced infant birth weight? Occup Environ Med 2002 ;44(9):815-21.Eunhee Ha, Sung-il Cho, Dafang Chen et al, Parental exposure to organic solvents and reduced birth weight. Archives of Environmental Health,2002;57(3):207-212.Chen C, Wang X, Chen D, et al

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20、kosh A, Chen D, et al Prospective Study of Exposure to Environmental Tobacco Smoke and Dysmenorrhea. Environmental Health Perspectives. November 2000; 108(11):1019-22. Ronnenberg AG, Wood RJ, Wang X, Xing H, Chen C, Chen D, et al. Preconception Hemoglobin and Ferritin Concentrations Are Associated with Pregnancy Outcome in a Prospective Cohort of Chinese Women. J Nutr. 2004;134(10):2586-2591.,电子狗又称反测速雷达，是一种提示驾驶者附近是否有雷达测速仪的设备，安装在汽车内，通过接收雷达波，可以在一定距离内检测到周围是否有雷达测速仪。汽车在行使过程中，当汽车靠近雷达测速仪时反测速雷达则会发警告。,在大数据背景下，我们需要在数据的海洋中做一只敏锐电子狗,谢谢 !,