1、外文医学数据库,主讲人: 李薇,Pubmed,标引质量高,更新速度快,信息量大,使用方便,选择PubMed的n个理由,关于PubMed,PubMed PubMed数据库简介 PubMed数据范围 PubMed主页 PubMed检索方法 检索结果的处理 PubMed的个性化服务,PubMed是美国国家医学图书馆NLM所属的国家生物技术信息中心(NCBI)开发的一个以Web方式向用户提供服务的生物医学文献检索系统,是目前世界上查找医学文献利用率最高的网上免费数据库,一、PubMed数据库简介,Medline,OldMedline,PreMedline,Record supplied by publ
2、isher,二、PubMed的数据范围,(1950-1965),学科范围:基础生命科学临床生命科学 生物科学 解剖学组织学化学与药物心理学社会医学农业 医技设备学 医技工业学 医学信息学使用词表:MeSH(医学主题词表),收录范围:来源于美国和世界上70多个国家和地区、50种语言的7395种权威生物医学及相关学科期刊,内容涉及生物医学各个领域;85%以上原文为英语,80%记录有文摘,5%免费全文。目前记录已达约2200万条,约40万篇/年 。回溯时间:1966年至今。记录中有indexed for MEDLIEN标记,MEDLINE数据库简介,一种由正在加工处理中的文献记录组成的数据库,这些新
3、记录还未被或正在标引,暂时存放在PreMEDLINE数据库中。每天更新,经过标引(增加主题词、文献类型、数据库存取号等字段)以后转入Medline,一旦记录被转入到Medline数据库,就被从PreMEDLINE数据库中删除。记录中有PubMed-in process的标记。,PreMEDLINE,Pre-Medline最新信息,Medline,New Data,Collect,PubMed,Process,一周以后,出版商提供的书目信息(Record supplied by publisher),出版商直接向PubMed提供的非Medline收录的电子刊物,记录标有Record as sup
4、plied by publishers标记。(如:Science或Nature中的地质学文献等)。,标记不同,出自分库亦不同,获取生物医学权威期刊最多 世界上70多个国家的7395种权威期刊多种检索方法,多条检索途径时效性极强(每周更新)回溯年代久远(1950年至今)利用MeSH作为转换词表,标引质量高部分文献可以免费获取全文检全率、检准率高,PubMed简介,PubMed主页,进入途径:http:/ http:/www.pubmed.gov http:/www.ncbi.nlm.nih.gov/PubMed http:/www.ncbi.nlm.nih.gov/sites/entrez,三、
5、PubMed的检索途径和方法 基本检索 高级检索 主题检索 期刊检索 专用检索,17,Pubmed 主页界面http:/www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/,基本检索输入框,检索限制,高级检索,常用工具,其他资源:,个人空间,使用帮助,1、逻辑运算符:OR、AND、NOT 运算顺序:ORANDNOT,可用()改变检索词的 处理顺序。2、截词符:*eg: cell*:cell、cells、celliferous、cellophane和cellular等词 的文献。3、利用字段标识符进行限定检索: 检索式格式:检索词A字段标识B,检索在字段中含有检索词A的文献。如: hepat
6、itisTI,smith AU 。4、“ ”,将短语做为不可分割的整体进行检索。 如:“OXYGEN FREE RADICALS ”注意: 和“ ”必须为英文或中文半角。,检索运算符,PubMed检索字段标识,Pubmed简单检索实例例一 查找有关“肝癌和肝炎的关系”的文献,英文“liver cancer ” 和 “hepatitis”,检索文献数量,题录格式内容,在西文文献里,著者的署名一般名在前姓在后,例:著者“Henry Hemila”应转换成“ Hemila h”,后加著者字段限定来检索,注意:姓在前,名在后 姓全称,名缩写,作者限定字段检索,例二 查找作者 Hemila h著作的文献
7、,三、PubMed的检索途径和方法 基本检索 高级检索 主题检索 期刊检索 专用检索,检索史,字段选择,点击Edit可编辑检索框里面的策略式,四、PubMed的检索途径和方法 基本检索 高级检索 主题检索 期刊检索 专用检索,PubMed主题词检索,MeSH(Medical Subject Headings)即医学主题词,是用规范化的医学术语来描述生物医学概念。NIH(国家卫生研究所)的工作人员按MeSH词表规定,浏览生物医学期刊全文后标引出每篇文献中的MeSH主题词,其中论述文献中心的主题词称主要主题词(major topic headings),论述主题某一方面的内容的词称为副主题词(Su
8、bheadings)。,Mesh Database医学主题词表,医学主题词表是对生物医学文献进行主题分析、标引和检索的权威性词表。功能:确定规范化主题词查看主题词词义注释、树状结构表选择副主题词、扩展下位主题词、指定主要主题词,进入途径:,MeSH Database:例1:从主题途径查找FK506副作用例2:从主题途径查找肾移植的文献,检索流程第一步:主题分析 英文转换FK506 adverse effectskidney transplantation点击MeSH Database Mesh界面 输入检索词 Go,第二步:选定该主题词 主题词轮排表点击该主题词 主题词细节屏,主题词轮排表,他
9、克莫司,第三步:主题词细节屏(主题词词义注释、副主题词、加权或不扩展、入口词、曾用词、树状结构) 选择合适的副主题词 选择加权或不扩展 send to,主题词细节屏,主题词词义注释,副主题词选择,加权检索,不扩展检索,入口词,曾用词,药理作用,树状结构,点击搜索生成器,第四步:search box 点击 search PubMed 检索结果,点击搜索PUBMED,题录格式界面,逻辑组配(#6 and #9),Pubmed主题词检索的功能: (1)理解词义和收入词表的时间 (2)限定副主题词 ,提高查准率。 (3)加权检索,提高查准率。(4)了解树形结构,扩展检索,提高查全率 (5)了解同义词,
10、提高查全率。,PubMed的检索途径和方法 基本检索 高级检索 主题检索 期刊检索 专用检索,Journal Database (期刊数据库) 可输入刊名全称、缩写或国际标准期刊号(ISSN)检索特定期刊的编目信息;,引文匹配器使用栏位化的检索方式,找寻特定刊名、卷期、作者、篇名的文献资料。,PubMed 一、PubMed数据库简介二、PubMed数据范围三、PubMed主页四、PubMed检索方法 五、检索结果的处理六、PubMed的个性化服务,检索结果处理,检索结果的显示与标记 检索结果的保存及定购,结果排序方式,每页显示记录数,结果显示格式,检索结果显示默认为题录格式每页显示20条记录,
11、纯文本方式显示,纯文本显示记录,文摘显示格式,MEDLINE格式,可链接到SpringerLink数据库获取全文,可链接到PubMed中心获取免费全文,全文链接图标,选择“File”,可完成将记录保存为文件;选择“clipboard”,可将记录保存在剪贴板选择“E-mail”,可以通过邮件发送记录,剪切板静止状态下最长保存8小时,最多可以保存500条记录,以邮件方式发送记录,填写邮箱地址,PubMed 一、PubMed数据库简介二、PubMed数据范围三、PubMed主页四、PubMed检索方法 五、检索结果的处理六、PubMed的个性化服务,PubMed的个性化服务,保存检索式(生成URL或
12、HTML实现共享),检索结果的分类过滤,特定功能的参数设置,PubMed的个性化服务,书目管理设置,PubMed快速检索功能的实现,NCBI Search Toolkit,安装“NCBI Search Toolkit”划词右击直接进行pubmed检索,PubMed的个性化服务,PubMed其实还有更加丰富多彩的内容等着你去挖掘,http:/www.nlm.nih.gov/medlineplus/,查阅各种健康疾病相关的主题,医药信息。还有一部非常完善的在线医学词典。此外,你还可以浏览到很多有用的健康新闻。,PubMed的个性化服务,http:/www.gopubmed.org,GoPubMed
13、是德国Transinsight公司和德国德累斯顿大学合作,利用生物信息学相关知识开发的一个可以对PubMed检索结果进行探索、分析的工具。,PubMed的个性化服务,舌根肿瘤的病理学,阿司匹林治疗心肌梗死,实战二,实战三,实战一,PubMed检索实例,Asthma drug therapy,Tonguetongue basebase of the tongueneoplasms pathology,Aspirintherapeutic use myocardial infarctiondrug therapy,帮我查一下北京301医院张永刚教授2014年发表在AO Spine或Europe Spine关于强直性脊柱炎后凸畸形手术治疗的文章。脊柱炎,强直性英文主题词spondylitis, Ankylosis 脊柱后凸项文主题词为kyphosis,具体实例演示:,Thank you!,姓名:李薇电话:85619479QQ:410834804图书馆咨询2群:385331722,
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