中文生物医学文献数据库检索.ppt

1、中文生物医学文献数据库检索,北京大学医学图书馆信息咨询部,主要内容,中国生物医学文献服务系统（SinoMed）中国生物医学文献数据库（CBM）北京协和医学院博硕学位论文数据库中国医学科普文献数据库中文生物医学期刊文献数据库（CMCC）,（一）中国生物医学文献服务系统,系统概况检索技巧和方法检索结果的处理检索实习,1. CBM简介,中国生物医学文献数据库收录 1978 年以来 1600 多种中国生物医学期刊，以及汇编、会议论文的文献题录，年增长量约 40 万条。学科覆盖范围涉及基础医学、临床医学、预防医学、药学、中医学及中药学等生物医学的各个领域。中国生物医学文献数据库注重数据的规范化处理和知识

2、管理: 美国国立医学图书馆最新版医学主题词表； 中国中医研究院中医药信息研究所中国中医药学主题词表； 中国图书馆分类法 医学专业分类表。,1. CBM简介,中国生物医学文献数据具有如下特点： 词表辅助检索功能：检索系统具有多种词表辅助检索功能，建有主题词表、中英文主题词轮排表、分类表、期刊表、索引词表、作者表等多种词表，且有丰富的注释信息。检索入口多：除 30 多个检索入口外， 更提供特色的主题词检索、分类检索、第一著者检索、文献类型、资助项目和参考文献等检索方式。检索功能完备：定题检索、限定检索、截词检索、通配符检索，各种逻辑组配检索功能会大大提高检索效率。全文获取：目前 CBM 已经实现了

3、与维普全文数据库的链接功能，对于 1989 年以来的全文，可以直接链接维普全文数据库。,规范化处理之前,标题：氯沙坦对肾血管性高血压大鼠血清中血管紧张素-1受体自身抗体产生的影响 著者：支建明; 刘忠保; 焦向英; 刘迎旭; 赵荣瑞著者单位：太原山西医科大学生理学教研室 030001文摘：目的和方法:采用两肾一夹型肾血管性高血压(RVH)模型,以合成的大鼠血管紧张素-1受体(AT1R)细胞外第二环165-191位氨基酸序列作为特异性抗原,用ELISA法检测大鼠血清中血管紧张素-1受体自身抗体,动态观察(13周)氯沙坦(术后第2周开始,5 mg/kg dig,连续12周)治疗对模型大鼠AT1R自

4、身抗体产生的影响。结果:RVH组大鼠血清中AT1R自身抗体从术后1周起阳性率、滴度逐渐升高;给予氯沙坦治疗不仅可抑制模型大鼠心脏功能和结构的改变,而且使血清AT1R自身抗体的阳性率和滴度明显低于肾血管性高血压组。结论:氯沙坦坦有抑制AT1R自身抗体产生而达到降压的作用。出处：中国应用生理学杂志 2003.02.28; 19(1): 43-46关键词：大鼠; 氯沙坦; 肾血管性高血压; 受体; 血管紧张素; 自身抗体,规范化处理之后,分类号： R-332; R392.11; R544.140.53; R916.4; R978.5 标题：氯沙坦对肾血管性高血压大鼠血清中血管紧张素-1受体自身抗体产

5、生的影响 著者：支建明; 刘忠保; 焦向英; 刘迎旭; 赵荣瑞 著者单位：太原山西医科大学生理学教研室 030001 文摘：目的和方法:采用两肾一夹型肾血管性高血压(RVH)模型,以合成的大鼠血管紧张素-1受体(AT1R)细胞外第二环165-191位氨基酸序列作为特异性抗原,用ELISA法检测大鼠血清中血管紧张素-1受体自身抗体,动态观察(13周)氯沙坦(术后第2周开始,5 mg/kg dig,连续12周)治疗对模型大鼠AT1R自身抗体产生的影响。结果:RVH组大鼠血清中AT1R自身抗体从术后1周起阳性率、滴度逐渐升高;给予氯沙坦治疗不仅可抑制模型大鼠心脏功能和结构的改变,而且使血清AT1R自

6、身抗体的阳性率和滴度明显低于肾血管性高血压组。结论:氯沙坦坦有抑制AT1R自身抗体产生而达到降压的作用。 出处： 中国应用生理学杂志 2003.02.28; 19(1): 43-46 关键词：大鼠; 氯沙坦; 肾血管性高血压; 受体; 血管紧张素; 自身抗体 主题词 ：大鼠, 近交SHR; 高血压, 肾血管性/*药物疗法; 高血压, 肾血管性/免疫学; 疾病模型, 动物; 洛沙坦/*治疗应用; 受体, 血管紧张素/*免疫学; 受体, 血管紧张素/拮抗剂和抑制剂; 自身抗体/*血液 特征词： 大鼠; 动物,利用中国图书馆分类法 医学专业分类表,利用主题词表,CBM有3个版本：光盘版: CBMdi

7、scWeb版：CBMweb 系统集成版：SinoMed,1. 系统概况,中国医学科学院医学信息研究所开发研制内容覆盖：中国生物医学文献数据库（CBM）西文生物医学文献数据库（WBM）日文生物医学文献数据库俄文生物医学文献数据库英文文集汇编文摘数据库英文会议文摘数据库北京协和医学院博硕学位论文数据库中国医学科普文献数据库,中国生物医学文献数据库（CBM） 收录1978年以来1600余种中国生物医学期刊，以及汇编、会议论文的文献题录530余万篇，全部题录均进行主题标引和分类标引等规范化加工处理。年增文献40余万篇，每月更新。中国医学科普文献数据库 收录2000年以来国内出版的医学科普期刊近百种，文

8、献总量8万余篇，重点突显养生保健、心理健康、生殖健康、运动健身、医学美容、婚姻家庭、食品营养等与医学健康有关的内容。每月更新。北京协和医学院博硕学位论文库 收录1981年以来协和医学院培养的博士、硕士研究生学位论文，学科范围涉及医学、药学各专业领域及其他相关专业，内容前沿、丰富，可在线浏览全文。每季更新。,1. 系统概况,2. 检索技巧和方法,基本检索 主题检索 分类检索 期刊检索 作者检索 我的空间,2.1 基本检索,美托洛尔治疗高血压的文献关键词美托洛尔高血压,2.1 基本检索,跨库检索：逻辑组配检索 ：“AND”（逻辑与）、“OR”（逻辑或）、“NOT”（逻辑非） 通配符检索 单字通配符

9、（?）：? 替代一个字符 ，如“血?动力 ”任意通配符（%）： %替代任意个字符 ，如“肝炎%疫苗”短语检索检索词中含有“-”、“(”、“,”等特殊符号时 半角双引号 （” ”）模糊检索 输入的检索词包含在命中文献的检索字符串中 二次检索 在已有检索结果的基础上再检索，逐步缩小检索范围 智能检索CBM自动实现检索词、检索词对应主题词及该主题词所含下位词的同步检索限定检索 限定年代、文献类型、研究对象、性别等,跨库检索,通配符检索,输入“血?动力”,输入“肝炎%疫苗”,短语检索,输入1,25-(OH)2D3,模糊检索,智能检索,如：在CBM的“缺省”字段输入“艾滋病”，勾选“智能主题”后点击“检

10、索”按钮，系统自动检出“中文标题”、“摘要”、“关键词”、“主题词”等字段中含“艾滋病”、“AIDS”和“获得性免疫缺陷综合征”的所有文献。,限定检索,CBM限定条件详细说明,检索练习,2000-2010年发表的关于美托洛尔治疗高血压的综述文献限定条件2000-2010年综述关键词美托洛尔高血压,基本检索练习,1. 北京大学第三医院发表的文章(北京%大学%第三%医院) and (100083 or 100191) 2. 1992-2005年发表的有关成年人艾滋病合并肺炎的文献,2.2 主题检索,主题检索是基于文献内容的主题概念进行检索，有利于提高查全率和查准率。主题检索的依据 ： 医学主题词表

11、（MeSH）中译本 中国中医药学主题词表,关键词（自由词） 主题词 艾滋病 AIDS 爱滋病,获得性免疫缺陷综合征,规范化处理之前,标题：艾滋病并发结核致免疫重建炎性综合征的临床及影像表现著者：袁春旺; 赵大伟; 梁连春; 李在村; 陈枫; 段勇; 王微著者单位：首都医科大学附属北京佑安医院放射科, 100069文摘：目的:探讨艾滋病(AIDS)并发结核患者在高效抗逆转录病毒治疗(HAART)中发生免疫重建炎性综合征(IRIS)的临床特征及影像表现。方法:回顾分析4例AIDS并发结核患者在HAART中发生IRIS的临床及影像资料。结果:以上临床及影像表现均具有临时性及白限性特征,随着抗结核及H

12、AART联合治疗的继续,病情均出现好转。结论:AIDS并发结核患者在HAART中均有可能发生IRIS,影像检查对IRIS的早期诊断、病情监测、疗效评价及治疗具有重要的作用。出处：中华放射学杂志 2008; 42(2) : 149-151,规范化处理之后,分类号： R442.8; R512.91; R52; *R734.2标题：艾滋病并发结核致免疫重建炎性综合征的临床及影像表现著者：袁春旺; 赵大伟; 梁连春; 李在村; 陈枫; 段勇; 王微著者单位：首都医科大学附属北京佑安医院放射科, 100069文摘：目的:探讨艾滋病(AIDS)并发结核患者在高效抗逆转录病毒治疗(HAART)中发生免疫重建

13、炎性综合征(IRIS)的临床特征及影像表现。方法:回顾分析4例AIDS并发结核患者在HAART中发生IRIS的临床及影像资料。结果:以上临床及影像表现均具有临时性及白限性特征,随着抗结核及HAART联合治疗的继续,病情均出现好转。结论:AIDS并发结核患者在HAART中均有可能发生IRIS,影像检查对IRIS的早期诊断、病情监测、疗效评价及治疗具有重要的作用。出处：中华放射学杂志 2008; 42(2) : 149-151主题词：结核/并发症; 结核/*放射摄影术; 获得性免疫缺陷综合征/并发症; 获得性免疫缺陷综合征/*放射摄影术; 综合征; 回顾性研究; 炎症/病因学; 炎症/*放射摄影术

14、,利用中国图书馆分类法 医学专业分类表,利用主题词表,主题词 ： 结核/并发症; 结核/*放射摄影术; 获得性免疫缺陷综合征/并发症; 获得性免疫缺陷综合征/*放射摄影术; 综合征; 回顾性研究; 炎症/病因学; 炎症/*放射摄影术,2.2 主题检索,主题词/副主题词组配检索 主题词：自然语言的规范化用语如主题词“获得性免疫缺陷综合征”涵盖了“艾滋病”、“AIDS”、“爱滋病”等词语。 副主题词：用于对主题词的某一特定方面加以限定如：治疗、诊断、药物作用等主题词/副主题词组配检索如：“肝/药物作用”表明文章讨论药物对肝脏的影响,主题词加权检索 仅对加星号（*）主题词（主要概念主题词）检索非加权

15、检索表示对加星号和非加星号主题词（非主要概念主题词）均进行检索,2.2 主题检索,标题： RNA干扰血管紧张素受体对肾血管性高血压大鼠血压及心肌肥厚的影响主题词： *RNA干扰; 高血压, 肾血管性/*病理生理学; 高血压, 肾血管性/遗传学; 高血压, 肾血管性/治疗; 心脏扩大/*病理生理学; 血压/*生理学; 血压/遗传学,标题：肾动脉直接支架置入治疗肾血管性高血压5例主题词：高血压, 肾血管性/*治疗; 可行性研究; 气囊扩张术; *肾动脉; *支架,若使用“高血压，肾血管性/治疗”的加权检索就检索不到A文献,A文献,B文献,扩展检索 主题词扩展检索：对当前主题词及其下位主题词进行检索

16、 副主题词扩展检索：对当前副主题词及其下位副主题词进行检索,2.2 主题检索,2.2 主题检索,例1. 在中国生物医学文献数据库（CBM）中利用主题途径检索有关“骨关节结核治疗”的文献。,主题词树状结构本例“结核，骨关节”有下位词“结核，脊柱”,选择“加权检索”、“扩展检索”，添加组配相应的副主题词“治疗”后，点击“主题检索”按钮进行文献检索。,主题检索练习,检索有关肾血管性高血压的诊断的文献肾血管性高血压诊断,2.3 分类检索,通过分类导航逐级展开来实现在类名、类号输入框输入学科类名或类号分类号扩展检索 ：对该类号及其下位类号进行查找复分组配检索 ：对于可复分的类号，选择复分组配检索（可选择

17、多个复分号）,2.3 分类检索,例3. 查找关于“婴幼儿麻疹病因”方面的文献,分类检索界面，选择“类名”检索字段并输入检索词“麻疹”,类名列表中选择准确类名“小儿麻疹”,选择复分组配检索（可选择多个复分号）；最后点击“分类检索”按钮,2.4 期刊检索,目标期刊定位：可通过检索入口处选择刊名、出版地、出版单位、期刊主题词或者ISSN直接查找期刊；也可通过“期刊分类导航”或“首字母导航”逐级查找浏览期刊；期刊文献查找：可以直接指定年、卷期进行浏览；也可以输入欲检索的内容后在指定的年卷期中查找浏览具体文献。,2.4 期刊检索,例4. 通过中华医院管理杂志了解农村医疗机构管理方面的研究进展情况。,2.

18、5 作者检索,二次检索法作者机构限定检索法 与二次检索法相比，作者机构限定检索支持作者精确定位，能够比较有效地解决“同名著者”、“同构异名”问题，提高查准率与查全率。,2.5 作者检索,例5. 在中国生物医学文献数据库（CBM）中查找“中国医学科学院基础医学研究所沈岩教授”以第一著者身份发表的论文情况。 二次检索法作者机构限定检索法,（1）二次检索法,“基本检索”界面，选择“第一作者”检索入口，输入“沈岩”，点击“检索”按钮,（1）二次检索法,检索结果界面，选择“作者单位”检索入口，输入该作者所在机构名称“中国医学科学院基础医学研究所”，勾选“二次检索”后点击“检索”按钮,（2）作者机构限定检

19、索法,（2）作者机构限定检索法,作者列表中选择作者“沈岩”，并点击“下一步”按钮,（2）作者机构限定检索法,作者机构列表中选择该作者所在机构，然后点击“完成”按钮。,2.6 我的空间,“个人用户” 直接使用系统注册时所用的用户名和密码即可登录“我的空间”；但“集团用户”下的子用户则需要单独注册后才可登录使用 定题检索在开展某项课题研究时，需要及时跟踪国内外在该领域的研究进展，把握最新研究动态和成果 创建个人数据库来保存感兴趣的检索结果 可以对感兴趣的文献进行保存、管理与再利用。,3. 检索结果的处理,检索结果的分析CBM从不同角度（作者、出版时间、作者单位、来源期刊、加星主题词和文献类型）对检

20、索出来的文献进行分析 检索结果显示、打印和保存 结果显示格式：“题录格式”、“文摘格式”、“详细格式”结果输出方式： 打印、保存和E-mail 排序方式：“年代”、“作者”、“期刊”、“相关度” 全文获取 ：CBM数据库与维普科技期刊全文数据库链接 提供北京协和医学院博硕学位论文的在线原文阅读功能 原文索取 ：通过填写“全文申请表”、“文件导入”等方式申请所需要的文献,4. 检索实习,例1：腹痛的并发症 检索课题中包含两个主要概念：腹痛、并发症采用主题词途径和基本途径相结合方法进行检索。,第一步，输入相应的中文主题词 “腹痛”为了不遗漏文献，主题检索有关设置为：主题词扩展、不加权 ，组配相应的

21、副主题词“并发症”， 并设置为“扩展副主题词” ；第二步，在缺省字段中输入（腹痛 OR 腹疼）AND 并发症进行基本检索；第三步，点击“检索历史”，根据尽量不遗漏文献的需要， 在检索框中输入 #1 OR #2 或者点选相应检索式前的方框，再点击“OR”按钮，进行检索。,例1：腹痛的并发症,检索策略：#1 主题词=腹痛/CO/全部树#2 （腹痛 OR 腹疼）AND 并发症#3 #1 OR #2,习题,1. 检索有关“新生儿窒息的诊断”的综述文献2. 检索“北京大学的王宪2002年发表的有关动脉粥样硬化”的文献3. 检索“女贞子治疗老年便秘”的文献,（二）中文生物医学期刊文献数据库,CMCC简介检

22、索方法与技巧检索结果的显示CBM与CMCC的比较,1.CMCC简介,是由解放军医学图书馆数据库研究部开发的中文生物医学文献目录型数据库。收录范围：基础医学，临床医学，预防医学，医学生物学，中医药学，药学，医院管理，医学信息学等卫生相关信息。CMCC新，更新速度快，收录期刊全（1400余种），可弥补CBM时滞长的缺点，特别有利于课题的查新和追踪检索。CMCC由1994年正式出版，半月一期，按年度存放文献数据。,CMCC有三个版本：,单独的CMCC 与CMCI集成在一起与CMAC集成在一起,2007年以前的数据,最新的数据,单独的CMCC系统,检索界面,2. 检索方法与技巧,基本检索高级检索引文检

23、索,2.1 基本检索,2.1 基本检索,2.1 基本检索,检索示例,检索胡大一以第一作者身份发表的文献检索北京大学第三医院发表的文献 北京*第三*医院,2.2高级检索,高级检索示例：禽流感的流行病学,3检索结果的处理,4. CBM与CMCC的比较,一般中文生物医学文献课题的检索过程 课题的主题分析和策略制定检索CBMdisc数据库（课题的回溯检索，了解课题的主要文献）结合现刊和网检文献的阅读，每半月检索一次CMCC（掌握最新文献信息，定题跟踪检索）课题修正循环检索课题完成,4.1 CBM的特点,主题检索功能强：CBM是受控的检索数据库，具有主题检索功能。它既可对单个主题词加权检索，也可扩展检索

24、，还可以选择副主题词进行方面组配，对查全率和查准率都有一定保证。CBM，界面友好，方便操作，检索途径多，还可以进行分类途径检索，还可以进行年限的限制。,收录1978年以来的文献题录 ，可进行课题的回溯检索。CBM属于浅标引，用主题词检索途径易造成漏检，要配合自由词检索。CBM更新慢，平均每四个月更新一次。,4.1 CBM的特点,4.2 CMCC的特点,新、快、全。更新快，半月一期。与印刷版比较，平均时滞为3个月，很好地补充了CBM的时间差。收录生物医学期刊1400余种，几乎囊括了（90%以上）生物医学正式出版的期刊。采用关键词标引，非受控数据库，没有主题词和分类检索途径，查全率和查准率难以保证。,