生物信息学硕博连读研究生培养方案.DOC

1、生物信息学硕博连读研究生培养方案一、培养目标本专业培养德、智、体全面发展的信息生物学科领域的高级专门人才。要求学生加强思想道德的学习和修养，热爱祖国，遵纪守法，品德良好。英语水平优秀，在本学科及相关学科上掌握坚实宽广的基础理论与系统深入的专门知识，具备在在信息生物学这一交叉学科领域独立开展科学研究的能力与创新意识，并具有从事高校教学、企业科技开发与管理等方面的工作能力，成为祖国现代化建设的高级专门人才。二、 研究方向1. 生物序列识别与调控2. 生物分子进化3. 基因药物设计4. 生物信息与生物纳米技术5. 细胞分子生物工程学三、 招生对象按中山大学学位与研究生教育工作手册的规定要求。四、 学

2、习年限按中山大学学位与研究生教育工作手册及中山大学文件中大研院（2003）3 号“中山大学硕博连读研究生培养工作试行办法”的规定执行。硕士学制三年。五、 课程设置类别 编号 课程名称 开课学期 学时 学分 任课教师（职称） 考核方式000002101 第一外国语(First Foreign Language) 1 120 5 外语学院 考试公共课 000002103 马克思主义理论(Theory of Marxism) 1，2 72 4 教育学院 考试必基础课0710222101 生物信息学（Bioinformatics） 1 80 4 何淼副教授 考试0710222102 生物统计学（Bio

3、statistics） 1 80 4 方颖讲师何淼副教授 考试0710222103 细胞与分子生物力学(Molecular and Celluar Biomechanics) 1 80 4 吴建华教授 方颖讲师 考试0710222104 细胞生物工程学（Celluar Bioengineering） 2 80 4 方颖讲师吴建华教授 考试0710222105信息生物学进展(Advanced in Bioinformatics)2 80 4 导师组 考试0710222106分子生物学研究技术 (Research Technology of Molecular Biology)1 80 4 屈良鹄

4、教授 考试修课*专业课3300002101 生命科学进展（Advance in Life Science） 1-2 80 4 徐安龙 考试0710222201 蛋白结构的理论预测(Protein 3D structure prediction) 2 40 2 吴建华教授 考试0710222202高等生物信息学导论（An Introduction of Advanced Bioinformatics）2 60 3 吴建华教授 考试0710222203高级数据库技术（Advanced DBMS Technology）2 40 2 倪德明副教授 考试0710222204 分子药物设计(Molecul

5、ar Drugs Design2 40 2 彭文烈副教授 考试0710222205 生物图像识别技术(Bio-image Recognition )3 40 2 赖剑煌教授 考试0710222206 Perl 语言（Perl Language） 2 40 2 张文军副教授 考试0710112101 生物电子显微学 (Biological Electronic Microscopy) 1 80 4 张勤奋副教授 李鲲鹏博士 考试0710102206 分子免疫学(Molecular Immunology) 3 60 3 徐安龙教授 考试0710222207 生物物理学专题(Biophysics)

6、2 40 3 吴建华教授 考试0710021242 蛋白质电子晶体学 (Protein Electronic Crystallography) 3 80 4 张勤奋副教授 李鲲鹏博士 考试0904022209计算机应用与软件设计(Computer Application Software Designing)3 60 3 张文军副教授 考试0710092101 细胞分子生物学（二）(Molecular Biology of the Cells) 1 60 3 欧阳学智教授 考试选修课专业选修课0710222208（新增） 微生物基因组学与生物信息学Microbial Genomics and

7、Bioinformatics2 60 3 艾云灿教授 考试实践课0710101204 教学实践(Teaching Experiment) 2 40 2 导师组 考核讲座 0710111209生物大分子结构与功能(Macromolecular Structure and Function)1-4 80 4 来访专家 考核*:由导师指定几门课程六、 考核方式按中山大学学位与研究生教育工作手册及中山大学文件中大研院（2003）3 号“中山大学硕博连读研究生培养工作试行办法”的规定执行。 。七、 学位论文工作及发表论文要求按中山大学学位与研究生教育工作手册及中山大学文件中大研院（2003）3 号“中山

8、大学硕博连读研究生培养工作试行办法”的规定执行。本专业特别要求必须在 SCI 源杂志上发表（含接受）一篇研究论文或在中文一级学报发表（含接受）二篇以上研究论文方可授予博士学位。八、 参考书目1. D.A. Lauffenburger and J.J. Linderman. “Receptors”, Oxford Univ. Press. 1993.2. Warren J. Ewens, Gregory R. Grant，Statistical Methods in Bioinformatics. Springer Press, 20033. Andreas D. Baxevanis, B. F

9、. Ouellette, Bioinformatics: A Practical Guide to the Analysis of Genes and Proteins. John Wiley & Sons Press, New York, 20024. Pavel A. Pevzner, Computational Molecular Biology: An Algorithmic Approach (Computational Molecular Biology). MIT Press, 1st edition, 20005. Michael S. Waterman, Introducti

10、on to Computational Biology: Maps, Sequences and Genomes. CRC Press, 19956. Isaac S. Kohane, Alvin Kho, Atul J. Butte, Microarrays for an Integrative Genomics (Computational Molecular Biology), MIT Press, 20027. David W. Mount, Bioinformatics: Sequence and Genome Analysis. Cold Spring Harbor Laborat

11、ory Press, 1st edition , 20018. R.Mannhold/H.Kubinyi/H.Timmerman, Bioinformatics. WILEY-VCH 20029. Osamu Hatase,Jerry H.Wang, Bioinformatics:information transduction and processing systems from cell to whole body. 198910. T K Attwood , D J Parry-Smith（罗静初等译） ，生物信息学概论“Introduction to bioinformatics”。

12、北京大学出版社， 200211. 郝柏林、张淑誉，生物信息学手册。上海科学技术出版社，200012. 赵国屏，生物信息学。科学出版社，200213. Andreas D.Baxevanis B.F.Francis Ouellette， （李衍达、孙之荣等译） ，生物信息学-基因和蛋白质分析的实用指南“Bioinformatics-A Practical Guide to the Analysis of Genes and Proteins ”。清华大学出版社， 200014. 山东大学生物系，基因组研究与生物信息学。山东大学出版社，200115. T.S.Bakeretal. Microbio

13、logy and Molecular Biology Review. Pre.1999 P862-92216. J. Dubochet. Cryo-electron Microscopy of Vitrified Specimens. Quarterly Review of Biophysics 21.2 (1988) pp.129228.17. T.A.布朗，基因组，科学出版社， 200218. Watson JD，et al. Molecular biology of the gene，199319. Robert F，Weaver. Molecular biology. McGraw-H

14、ill ，200220. David M. Hillis et al. Molecular Systematics，199621. Alfred Goodman Gilman，et al. The Pharmacological Basis of Therapeutics，eighth edition， Mcgraw-Hill Inc. 199522. 冯元桢著、邢善熙译， 生物力学：运动、流动、应力和生长 ，四川教育出版社，199323. 陈兰荪,陈健.非线性生物动力系统,北京:科学出版社,1993.24. Brown D. and Rothery P. Models in Biology:

15、 Mathematics, Statistics, & Computing. Wiley, Chichester. 199425. 张景强等， 生物电子显微技术 广州 中山大学出版社，1993。26. 阎隆乙等， 蛋白质分子结构 1999。27. 裘法祖等， 现代免役学实验技术 湖北科技出版社，1998。28. 卢圣栋， 现代分子生物学实验技术 科学出版社，1993。主要期刊： 中国科学，科学通报，生物数学学报，生物化学与生物物理学报，生物物理学报，生物化学与生物物理进展，电子显微学报，Nature, Science, Cell, Biophysical J., J. Cell Biology, Advances in Applied Mathematics，Applied Mathematical Modeling，European Communications in Mathematical and Theoretical Biology，Journal of Mathematical Biology