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PCR优化问题汇总(共6页).docx

PCR优化问题汇总一、 PCR在产物序列中引入了错误?参考见解:1. 聚合酶忠实性低:使用带有校正活性的热稳定聚合酶,如Platinum Pfx DNA聚合酶。2. 循环数太多:降低循环数。3. 四种dNTP的浓度不同:制备新的dNTP混合物,保证四种核苷浓度相同。使用预混合物。二、PCR跑胶,目的条带很亮,但是边沿不清楚,前后有拖尾现象?参考见解:1. 模板可能有降解,建议避免反复冻融,放置时间不能太长。模板的质量是最重要的。2. 抽提RNA时有污染,包括基因组DNA污染和蛋白质污染,需重做抽提。3. 提高退火温度,减少非特异性扩增。4. 减少循环次数,减少非特异性扩增。5. 电泳缓冲液时间太长,PH值和盐离子浓度明显改变。6. 电泳时电压不能太高,8V/cm。7. 一般来讲,基于promega和TaKaRa的PCR反应体系中,Mg和dNTP的浓度是相匹配的,不需改动。8. 加样的量过大。过多的量会造成加样孔超载,从而导致拖尾和弥散,对于较大的DNA此现象更明显。9. 制胶过程中胶孔没制好。10. EB没有冲洗干净。

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