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标签（亲和标签）亲和原理对融合蛋白影响酶切去除特点应用Poly-Arg碱性强氨基酸（强阳离子）阳离子交换柱可能影响蛋白三维结构羧肽酶B（得率低，专一性低）可以固定化功能蛋白质分析较少使用，可以标签联用Poly-His组氨酸的咪唑环作为电子供体与金属离子形成配位键对融合蛋白活性影响较小，但一般不排除影响的可能咪唑会影响NMR实验；咪唑使蛋白质聚集应用较多，带金属离子的蛋白质和厌氧条件不适用FLAGFLAG肽和抗体M1结合肠激酶非变性纯化；纯化基质比Ni2+-NTA不稳定Strep-tag IIStrep-Tactin(修饰的链球菌抗生物素蛋白)与strep-tag II结合可用于NMR和结晶实验研究：温和洗脱应用较多，用于带金属离子的蛋白质和厌氧条件蛋白纯化c-myc抗c-myc抗体9E10(特异性结合11个氨基酸的抗原表位)低ph洗脱可能降低蛋白活力广泛用于检测，少用于纯化SS-蛋白和S-tag的相互作用切掉标签获得有活性的目的蛋白
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