PCR 引物设计及相关软件使用 重庆大学生物工程学院 杨应斌 杨应斌主要内容 l背景 l PCR引物设计原则 l常用PCR引物设计软件 l Primer Premier 5.0 介绍 l Oligo 6.22 介绍 l在线Primer3 介绍PCR 聚合酶链反应(Polymerase Chain Reaction ,PCR)是80年代中期发展起来的体外核酸扩增技 术。它具有特异、敏感、产率高、快速、简便、 重复性好、易自动化等突出优点；能在一个试管 内将所要研究的目的基因或某一DNA片段于数小 时内扩增至十万乃至百万倍,使肉眼能直接观察 和判断；可从一根毛发、一滴血、甚至一个细胞 中扩增出足量的DNA供分析研究和检测鉴定。 PCR l引物设计是PCR 技术中至关重要的一环。 使用不合适的PCR 引物容易导致实验失败 ：表现为扩增出目的带之外的多条带（如 形成引物二聚体带），不出带或出带很弱 ，等等。现在PCR 引物设计大都通过计算 机软件进行。可以直接提交模板序列到特 定网页，得到设计好的引物，也可以在本 地计算机上运行引物设计专业软件。引物设计的原则 l引物与模板的序列要紧密互补 l
