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从质谱数据鉴定多肽蛋白质ppt课件.ppt

第四讲 从质谱数据鉴定多肽/ 蛋白质 中科院自动化所 李伏欣开场白 在之前的讲座中,我们已经学到了关于蛋白 质组学中的重要工具 质谱仪的知识。 蛋白质组学里,质谱仪的作用是鉴定混合物 中的蛋白质。然而,没有数据分析的辅助, 它是做不到这一点的。讲座大纲 本讲座中,将分别讲述两种鉴定蛋白质的方 法。其一是质量纹鉴定法(Peptide Mass Fingerprinting ),另外一种是二级质谱的数 据库搜索鉴定法(MS/MS Database Searching )。 我们将简略的介绍质量纹鉴定法。而用更多 的时间讨论用于二级质谱上的方法。多肽质量纹鉴定 多肽质量纹(Peptide Mass Fingerprinting , PMF )是从一级质谱(MS )中鉴定多肽的主 要方法。 多肽质量纹一般都是在MALDI-TOF 仪器的结 果上进行。 其原理就是利用了蛋白序列数据库中的多肽 质量的信息。 我们下面的讨论,先假设一张质谱图对应一 个蛋白。后面会讨论处理多个蛋白的情况。一级质谱图 蛋白质经过酶解后,送入质谱仪,得到一级 质谱。 目前来说,由MALDI-TOF 质谱仪产生的质谱 图精

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