第七章 分子系统发育分析 姚正培yao_本章内容 n 引言 n 生物进化的分子机制 n 系统进化树及其构建 n 分子系统发育分析软件及应用引言 n 生物学家：Wehaveadream q TreeofLife:重建所有生物的进化历史并以系统树的形 式加以描述引言 n 梦想走进现实：How? q 最理想的方法：化石！零散、不完整引言 n 梦想走进现实：How? q 比较形态学和比较生理学：确定大致的进化框架 细节存很多的争议引言 n 梦想走进现实：How? q 第三种方案：分子进化 n 1964年，美国进化生物学家E.Zuckerkandl和量子化学家 LinusPauling提出分子进化理论 n 基本假设 q 核酸和蛋白质序列中含有生物进化历史的全部信息 n 理论 q 分子进化速率恒定。 q 分子钟：物种的同源基因之间的差异程度与它们的共同祖先 的存在时间(即两者的分歧时间)有一定的数量关系。 n 发生在分子层面的进化过程：DNA,RNA和蛋白质分子引言 n 分子钟成立的证据： q 1、至少某些生物大分子（如珠蛋白）的进化速率在相 当长的地质时间内的相对稳定、均匀； q 2、许多不同物
