精选优质文档-倾情为你奉上新手指南篇：基于二代测序数据的比较基因组分析 摘要现在高通量测序既快又便宜，足以被视为细菌研究的重要工具，并且在公共领域有数以千计的细菌基因组序列供比较分析。 越来越多不同的群体研究，像临床和公共卫生实验室，进行细菌基因组分析，它们感兴趣与细菌遗传学和进化相关的广泛话题。例如疫情分析及致病性和耐药性的研究。在这个初学者的指南中，我们的目标是，为那些生物信息学背景的个人分析细菌基因组数据提供了一个切入点，让他们来回答自己的研究问题。我们假设读者熟悉遗传学和序列数据的基本性质，但不承担任何计算机编程技能。涉及的主要议题是组装，contig排序，注释，基因组比较及提取共有的输入信息。每个部分均使用公开可用的大肠杆菌数据和免费的软件工具，所有这些都可以在台式计算机上被执行。介绍和目的 现在高通量测序既快又便宜，足以被视为细菌研究的重要工具。越来越多不同的群体研究，像临床和公共卫生实验室，进行细菌基因组分析，它们感兴趣与细菌遗传学和进化相关的广泛话题。例如疫情分析及致病性和耐药性的研究。如今细菌的基因组序列，可以在许多实验室内部产生
