精选优质文档-倾情为你奉上与传统的分子对接相比,反向对接(inverse or reverse docking)用于鉴定大量受体中给定配体的靶标。反向对接可用于发现现有药物和天然化合物的新靶点、解释药物的分子机制和药物重新定位找到药物的替代适应症,以及检测药物不良反应和药物毒性。导语自2003年人类基因组计划宣布完成以来,研究人员一直在努力寻找与特定表型相关的分子靶点。已经开发了许多实验技术用于新疾病靶标的确证和先导化合物的发现。此外,蛋白质结构数量的增长和计算能力的提高使得先导化合物的高通量计算筛选成为可能。分子对接是一种在给定配体中搜索蛋白质中可能的结合姿势并计算结合亲和力的计算方法。因此,越来越需要开发一种计算工具发现新的靶标。通过发现不期望与先导化合物或现有药物结合的靶点,可以尝试消除不良副作用;或通过药物重新定位扩大药物的适应症。受此驱动,反向对接方式越来越受到关注。反向对接中,人们试图找到可以结合特定配体的蛋白质靶标。必要的过程类似于正向对接方法;准备数据集、寻找配体姿势以及对复杂结构进行评分和排序。然而,高计算成本和蛋白