16S信息分析报告2-北京奥维森(共17页).docx

精选优质文档-倾情为你奉上 16srDNA信息分析1.标准信息分析（初级）1.1 基本数据处理（使用内部撰写的程序对原始的测序数据进行基本处理） 通过Illumina平台（Miseq）进行Paired-end测序，下机数据经过去除低质量reads(Q20, 90%标准过滤)，并trim掉reads2 尾部100bp 低质量序列；每个样品数据产出详细统计结果见下表：表1-1 reads数据统计：# Samples# HQ reads (total)# HQ reads (meanSD)CA17110,6516,5092,175HC19163,6908,6153,081LK13127,4169,8012,858Total49401,7578,1992,992注：原来的样本中CA15由于原始Reads数太少（只有23条）而被删除，因此目前的样本总数为49个 1.2 去除 barcode 序列，引物序列及 tags过滤通过COPE软件（Co