1、郑州晟智科信教育培训中心(Zhengzhou SZKX education training center)第十一期基于 TCGA 及 SEER 等癌症公共数据库的信息挖掘和科研设计（实操篇）会议通知各事业单位：身处大数据时代，对于从事肿瘤研究的临床医生或基础科研人员，有没有一种可以既不做实验又不查病史，直接调用公共数据撰写发表 SCI 论文的方法呢？TCGA 和 SEER 等癌症公共数据库即提供了这样一种可能。TCGA 和 SEER 分别侧重于组学数据和临床数据，各有优势。TCGA（癌症基因组图谱）数据库是一个多组学的数据库，包括常见癌症的基因组、转录组、蛋白组、表观遗传组数据和与其关联的临
2、床数据，为挖掘有意义的组学变化和发现肿瘤发生、发展、转移等生物学机制提供了海量数据。美国的 SEER（癌症监测、流行病学和结果）数据库则是典型的临床医学数据库，是北美最具代表性的大型肿瘤登记注册数据库之一，收集了各个癌种的海量临床病理信息和预后数据，并向全世界免费开放，为临床医师的循证实践及临床研究提供了宝贵的第一手资料。据不完全统计，全世界基于 TCGA 和SEER 数据挖掘产生的文章已经超过 2000 篇，其中不乏最顶尖的学术期刊文章（如JAMA、新英格兰、 Nature、Cell 等），这一数目还在不断增长中。以往的 TCGA 课程往往侧重于 R 语言程序的讲解，不少学员反应难以掌握。本
3、课程立足应用和实战，宗旨是“临床医生听得懂、学得会，科研人员亦有收获”。本课程将从临床应用视角介绍癌症公共数据库 TCGA、SEER 的基本情况、数据库结构、数据获取方式及基本统计方法等，深度解析近年讲课人发表的基于 TCGA 和 SEER 数据挖掘的经典案例，重点对癌症公共数据库的数据挖掘和课题设计进行讨论，最后也将探讨在此基础上的基金申请、SCI 论文撰写策略。一、时间地点：2018 年 11 月 23 日-11 月 25 日 北京（时间安排：第一天报到 ，授课两天）2、学习目标：本次培训提供了一次系统掌握 TCGA 和 SEER 等癌症公共数据库数据结构、挖掘方法及分析流程的机会，目的在
4、于助力有志于利用这些公共数据库的临床医生以及转化研究的科研人员，帮助研究者去更好地挖掘利用这些免费的公共数据。本次培训不侧重于深入的生物信息学分析讲授，拟解决的问题包括：1、如何基于TCGA 及 SEER 等癌症公共数据库设计课题；2、TCGA 及 SEER 数据库的数据下载；3、获取数据后如何分析；4、如何在此基础上撰写 SCI 论文及申请科研基金。三、授课方式:1、上机操作； 2、专题小组研讨与案例讲解分析结合； 3、课程讲座；4、参会对象：主要面向从事肿瘤研究的临床医生、转化研究科研人员、在校研究生以及广大临床肿瘤研究领域的科研工作者。 郑州晟智科信企业管理咨询有限公司二零一八年十月三十
5、日 郑州晟智科信教育培训中心(Zhengzhou SZKX education training center)五、主讲专家:本次主讲老师是来自国内知名三甲医院肿瘤专业的临床医生和科研工作者，有着丰富的临床和转化研究经验，成功用 TCGA、SEER 数据库发表十几篇 SCI，平均影响因子 4.6 分一篇，主持国家自然科学基金面上项目等多项省部级基金。六、注册费用：费用：3000 元（报名费、注册费、资料费、会议费、午餐费等）食宿可统一安排，费用自理。优惠政策：11 月 15 日前报名注册学员，每人优惠 200 元；七、颁发证书：参加学习的学员可以获得：生物信息工程师结业证书。此证书可作为个人学
6、习和知识更新、专业技能提升、单位人才聘用的参考依据。八、报名方式：请各单位接此通知后，尽快确定参会人员，认真填写报名回执并传真至：0371-86073066或发 E-mail 至: ，会务组收到回执后将通知相关报到事宜。九、联系方式：电 话/传真：0371-86073066 QQ：1445908422联系人：杨敏 158-3834-2318（同微信） E_mail： 报名回执表：基于 TCGA 及 SEER 等癌症公共数据库的信息挖掘和科研设计会议郑州晟智科信教育培训中心(Zhengzhou SZKX education training center)附件二：课程大纲第一天上午：TCGA
7、数据库入门1.TCGA 数据库基本概念介绍2.TCGA 数据获取上机操作实战3.案例解读：基于 TCGA 数据库发表文章的深度解析第一天下午：SEER 数据库挖掘1.SEER 数据库入门（软件安装、数据获取、数据检索）2.上机操作实战：SEER 数据库注册、数据获得、处理和分析3.案例解读：基于 SEER 数据库发表文章的深度解析第二天上午：TCGA 和 SEER 数据深度挖掘1.精准医学时代，如何利用公共癌症组学数据助力科研2.利用 Excel、SPSS、Graphpad 进行基于 TCGA 数据挖掘文章的深度解析a)如何实现 TCGA 原始数据的整理b)如何使用 Excel 进行不同数据表
8、的拼接单位名称纳税人识别号通讯地址 邮 编联系人 电 话 传 真学员姓名 性别 部门 职务 联系电话*手机 E-mail合计费用： 万 仟 佰 拾 元 电汇日期汇款账户账户：郑州晟智科信企业管理咨询有限公司开户行：中国工商银行股份有限公司郑州黄委会支行账号：1702 6206 0920 0015 091 注：请将银行汇款凭证传真至会务组。交费方式： 现场办理费用（可刷卡、现金） 电汇 （请用“”标注）是否需要住宿： 口是 口否入住日期_，住宿天数_天，标准间_间。参会单位盖章：参会学员签名：会务负责人：王辉 二零一八年 月 日郑州晟智科信教育培训中心(Zhengzhou SZKX educat
9、ion training center)c)如何在整理数据表基础上进行各种统计分析和作图3.利用 R 程序进行 TCGA 数据挖掘a)R 语言基础知识b)如何利用 R 程序实现单个样本文件的拼接和计算c)如何利用 R 程序进行图形制作d)如何利用 R 程序制作 nomogram第二天下午：标书论文撰写与实用统计方法1.医学基金标书撰写技巧2.SCI 论文撰写技巧a)SCI 论文框架与写作思路b)SCI 论文图表制作技巧c)如何撰写 Cover Letter 并在修回时与审稿人有效沟通3.实用科研统计方法实战以 GraphPad 和 SPSS 软件使用为例a)直方图、散点图、折线图、生存曲线、热图等常用统计图形制作b)t 检验、ANOVA、卡方检验、生存分析、多因素 Logistic 回归实现
