第十章 分子进化和分子系统学 生物进化是以生物大分子为基础的,只有从分子水平上研究生物的进化才能触及生物进化的本质,同时也使我们采用更加直接的手段研究生物进化成为可能。 究竟什么是分子进化,什么是分子系统学、分子进化的特点又是什么,如何建立分子系统树等,诸如此类的问题是本章要讨论的重点。 一、什么叫分子进化 广义的分子进化有两层含义,一是指原始生命出现之前的进化,即生命起源的化学演化;二是原始生命产生之后生物在进化发展的过程中,生物大分子结构变化以及这些变化和生物进化的关系等。我们通常所说的分子进化指的是后者。 二、分子进化的特点 ( 一) 分子进化速率的恒定性 分子进化速率是指核酸或蛋白质等生物大分子在进化的过程中碱基或氨基酸发生替换的频度,它是测定生物大分子进化快慢的尺度,时间以年为单位。 研究方法主要是通过比较不同种生物同源蛋白质氨基酸序列的变化,来推断该蛋白质的进化速率,为生物进化提供一个时间表。 M O Dayhof 对蛋白质的氨基酸变化进行了广泛的研究,收集了大量的数据,其中研究最详细最深入的蛋白质是脊椎动物的血红蛋白( 珠蛋白) 和肌红蛋白。血红蛋白在血液中运输氧和二氧化