第三节计算机辅助药物设计简介学习目标 熟悉计算机辅助药物设计的基本原理 了解对接术,构象分子场分析法,3-D定量构效关系,药效结构模型法 简介 20世纪80年代初期计算机辅助分子造型术与合理药物设计相结合,发展成现总称为计算机辅助药物设计(CADD)的一大类方法. 计算机辅助药物设计是应用量子力学、分子动力学、构效关系等基础理论数据研究药物对酶、受体等的作用的药效模型,从而达到药物设计目的。计算机辅助药物设计的基本原理 首先通过X单晶衍射等技术获得受体大分子结合部位的结构,并且采用分子模拟软件分析结合部位的结构性质,如静电场、疏水场、氢键作用位点分布等信息。然后再运用数据库搜寻或者全新药物分子设计技术,识别得到分子形状和理化性质与受体作用位点相匹配的分子,合成并测试这些分子的生物活性,经过几轮循环,即可以发现新的先导化合物。计算机辅助药物设计大致包括活性位点分析法、数据库搜寻、全新药物设计。对接术(Docking) 分子对接法是基于受体的,即将小分子配体对接到受体的活性位点,并搜寻其合理的取向和构象,使得配体与受体的形状和相互作用的匹配最佳。在药物设计中,分子对接方法主要用来从化合物数