药物靶标发现与筛选ppt课件.ppt

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药物靶标发现与筛选基因靶标核糖核酸靶标蛋白靶标一、基因靶标 1、在基因数据库中搜寻药物靶标(1)表达序列标志(expressed sequence tag, EST)数据库 (2)归纳逻辑设计程序 EST是从一个随机选择的cDNA 克隆进行5端和3端单一次测序获得的短的cDNA 部分序列,代表一个完整基因的一小部分,在数据库中其长度一般从20 到7000bp 不等,平均长度为360 120bp 。EST 来源于一定环境下一个组织总mRNA 所构建的cDNA 文库,因此EST也能说明该组织中各基因的表达水平。首先从样品组织中提取mRNA ,在逆转录酶的作用下用oligo ( dT) 作为引物进行RT -PCR 合成cDNA ,再选择合适的载体构建cDNA 文库,对各菌株加以整理,将每一个菌株的插入片段根据载体多克隆位点设计引物进行两端一次性自动化测序,这就是EST 序列的产生过程。Copyrightrestrictionsmayapply.Kim, J.-M. et al. DNA Res 2006 13:275-286; doi:10.1093/dnares/dsl016Quantit

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