宏基因组上机操作手册(共7页).doc

精选优质文档-倾情为你奉上目录0. 准备工作上机步骤如下：mkdir /Metagenome#新建工作目录cd /Metagenome#进入工作目录cp -R /RealBio_Train/Metagenome/01_clean_reads ./#拷贝数据1. 宏基因组比对宏基因组的序列可以通过SOAPaligner比对软件，比对上目标基因组，从而进行物种注释或计算物种丰度。SOAPaligner需要先对目标基因组进行建库，建库命令如下：2bwt-builder SOAPaligner用法：soap a -b -D -o -2 -m -x 其他重要参数：OptionType Content-rINT匹配到多处时的策略：0：不显示；1：