1、大陆新发人兽共患肠道病毒 -沙波( SaV)病毒的鉴定分析上 海 交 通 大 学 华 修 国猪 SaV中国株的首次发现u 2008年 2月上海某猪场猪群爆发以腹泻为主要症状的疾病,其中仔猪尤为严重,并出现仔猪死亡。u 采取 7份腹泻仔猪粪便样品,同时采取正常仔猪粪便样品 90份。 排除黄痢等疾病。 PCV、 PRC、 TGEV、 PEDV检测,结果阴性; RT-PCR检测 SaV RNA。 腹泻仔猪粪样中检测到 SaV,健康仔猪粪样SaV 阴性; 测序、序列遗传进化分析; 动物(小型猪)回归试验(粪便悬液经过滤)。序列进化分析小型猪回归实验表明: SaV可导致仔猪腹泻。其他症状也与猪场仔猪症状
2、相同; 腹泻粪便样品中检测到 SaV病毒; 说明猪场中造成腹泻、仔猪死亡的即为 SaV病毒。猪 SaV中国株的全基因组测定与序列分析 根据 GenBank上已提交的 SaV全长序列, CLUSTAL比对后选择保守区域设计全长引物,共 15套简并引物; 对 5和 3采用 RACE方法扩增。 本分离株全长 7558nt,包括 9 nt的 5 UTR和 14 nt的 3 UTR; 同其他分离株一样本分离株含有两个开放式阅读框( ORFs); ORF1: 10 6774nt共 6765nt,其中 VP1从 5140-6774nt共1635nt; ORF2: 6771 7286nt共 516nt。 ORF2编码区 3 端变异较大。结果全基因组同源性比较基于 VP1的系统进化分析ORF2编码区 3 端分析氨基酸序列比对核酸序列比对