二、模型建立与计算2.1软件及所用模块的介绍2.1.1软件介绍我所使用的软件为Accelrys公司开发的MaterialStudio软件包，该软件功能强大，并可以在PC机上运行.它的主要应用领域包括：固体物理和表面化学、催化、分离与化学反应、高分子及软材料、材料表征与仪器分析、晶体与结晶、定量构效关系与配方设计。2.1.2模块的介绍在本课题中，主要运用模拟软件MaterialsStudio中的Discover模块和AmorphousCell模块，在这些模块中应用COMPASS力场。Discover模块是MaterialsStudio的分子力学计算引擎。它使用了多种成熟的分子力学和分子动力学方法，这些方法被证明完全适应分子设计的需要。以多个经过仔细推导的立场为基础，Discover模块可以准确地计算出最低能量构象，并可给出不同系综下体系结构的动力学轨迹。Discover模块还为AmorphousCell等提供了基础计算方法。周期性边界条件的引入使得它可以对固态体系进行研究，如非晶、晶体或溶剂化体系。另外，Discover模块还提供强大的分析工具，可以对模拟结果进行分析
