16srDNA信息分析1.标准信息分析(初级)基本数据处理(使用内部撰写的程序对原始的测序数据进行基本处理)通过Illumina平台(Miseq)进行Paired-end测序,下机数据经过去除低质量reads(Q20,90%标准过滤),并trim掉reads2尾部100bp低质量序列;每个样品数据产出详细统计结果见下表:表1-1reads数据统计:#Samples#HQreads(total)#HQreads(mean土SD)CA17110,6516,5092,175HC19163,6908,6153,081LK13127,4169,8012,858Total49401,7578,1992,992注:原来的样本中CA15由于原始Reads数太少(只有23条)而被删除,因此目前的样本总数为49个去除barcode序列,引物序列及tags过滤通过COPE软件(ConnectingOverlappedPair-End,),利用重叠关系将双末端测序得到的成对reads组装