05多位点序列分析(MLST)分析.docx

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资源描述

多位点序列分析(MLST)分析多位点序列分型的原理:MLST方法一般测定610个管家基因内部400600bp的核苷酸序列,每个位点的序列根据其发现的时间顺序赋予一个等位基因编号,每一株菌的等位基因编号按照指定的顺序排列就是它的等位基因谱,也就是这株菌的序列型(sequeneetype,ST)。这样得到的每个ST均代表一组单独的核苷酸序列信息。通过比较ST可以发现菌株的相关性,即密切相关菌株具有相同的ST或仅有极个别基因位点不同的ST,而不相关菌株的ST至少有3个或3个以上基因位点不同。多位点序列分析(MLST)分析多位点序列分型(MLST)是一种分子分型技术,通过该技术,通常会对部分精心挑选的管家基因(位点。进行测序。在典型的MLST方法中,重组的发生频率要比点突变高得多。因此,人们不会研究菌株之间的总的序列相似性。相反,而去筛选给定位点的每个序列与该位点的已知序列的相似性。如果序列不同,则将其视为新的等位基因,并为其分配唯一的(任意)等位基因编号。如果研究了七个管家基因,那么每个菌株的特征就是七个等位基因的图谱。等位基因图谱可被认为是由7个分类字符组成的字符集oM

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