primer5和Oligo的引物设计、使用方法.docx

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primer5和Oligo的引物设计、使用方法吴乃虎的基因工程原理一、引物设计stepbystep1、在NCBI上搜索到目的基因,找到该基因的mRNA,在CDS选项中,找到编码区所在位置,在下面的origin中,Copy该编码序列作为软件查询序列的候选对象。2、用PrimerPremier5搜索引物 打开PrimerPremier5,点击File-New-DNAsequence,出现输入序列窗口,Copy目的序列在输入框内(选择As),此窗口内,序列也可以直接翻译成蛋白。点击Primer,进入引物窗口。 此窗口可以链接到引物搜索”、“引物编辑”以及搜索结果”选项,点击Search按钮,进入引物搜索框,选择“PCRprimers”,“Pairs”,设定搜索区域和引物长度和产物长度。在SearchParameters里面,可以设定相应参数。一般若无特殊需要,参数选择默认即可,但产物长度可以适当变化,因为100200bp的产物电泳跑得较散,所以可以选择300500bp. 点击OK,软件即开始自动搜索引物,搜索完成后,会自动跳出结果窗口,搜索结

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