small RNA测序分析与研究.docx

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SmallRNA测序分析与研究http:/www.plob.org/2012/07/25/2789.html2012年07月25日Reviews共3636字暂无评论被围观153views+smallRNA是生物体内一类重要的功能分子,包括microRNA.siRNA和piRNA。它的主要功能是诱导基因沉默,调控细胞生长、发育、基因转录和翻译等生物学过程。基于新一代高通量测序技术的smallRNA测序,可一次性获得数百万条smallRNA序列,能够快速地鉴定某种组织在特定状态下的所有已知smallRNA并发现新的smallRNA,为smallRNA功能研究提供有力工具。一、研究内容1. 测序和基本数据处理对总RNA(或smallRNA)样品进行检测,检测合格后进行smallRNA样品制备,经过下A克隆检测合格之后上机测序。基本数据处理包括:图象识别、碱基识别、过滤接头序列和污染序列、去除低质量序列。2. 高级生物信息分析内容 smallRNA长度的分布统计;将smallRNA定位到基因组,探索其在全基因组的分布特征; 两个样本的公共序列和特

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