Vector NTI 关于序列对比作业.docx

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五种原核生物之间的同源重组性分析【摘要】通过VectorNTI序列分析软件比较变形链球菌、运动发酵单胞菌、霍乱弧菌、海氏肠球菌以及嗜热枯草芽孢杆菌5种16SrRNA碱基序列,可以得出在5种细菌两两重组过程中,海氏肠球菌与嗜热枯草芽孢杆菌之间的同源重组率最大,而变形链球菌与霍乱弧菌之间的同源重组率最低。【关键词】VectorNTI序列分析软件5种细菌同源重组性一、VectorNTI序列分析软件简介我们已经知道,由Informax公司(现在已经归入Invitrogen公司旗下)开发的一种高度集成、功能齐全的分子生物学应用软件,可以对DNA、蛋白质分子进行大量分析和操作。主要功能:1. DNA序列的ORF、Motif、功能区搜索,限制酶图谱,蛋白质翻译。2. PCR引物、测序引物、杂交探针的设计和评价。3. DNA测序片断的拼接4. 同源比较和系统发育树构建5. 蛋白质结构预测:三维结构、化学键、翻译后修饰位点、结构域等6. 模拟电泳:琼脂糖、PAGE二、细菌的同源重组定义:细菌重组即发生在一个完整的环状双螺旋DNA分子与一个单链或双链DNA分

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