第八章生物信息学资源检索ppt课件.ppt

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第八章 生物信息学资源检索 胡德华2目录第一节 生物信息学数据库概述 1第二节 核酸序列数据库 2第三节 蛋白质数据库 3第四节 基因组数据库4第五节 疾病基因数据库 53第一节 生物信息学数据库概述一一生物信息学数据库的类型 二二 生物信息数据收集与存贮 三三 生物信息学数据库的查找4一、生物信息学数据库的类型文献数据库 突变数据库 图谱数据库 结构数据库 序列数据库 类型按收录信息内容分 5二、生物信息数据收集与存贮 (一)生物信息数据的收集 生物信息数据收集与存贮 (二)生物信息数据的存贮 6(一)生物信息数据的收集 数据库与数据库合作数据库与测序中心合作数据库与期刊合作 建库的初期 4 数据交换 3 成批发送 2 直接发送 1 人工收集 7(二)生物信息数据的存贮1 记录格式主要有:EMBL 格式、GenBank 格式存贮格式2 序列格式 又称Pearson格式 三、生物信息学数据库的查找 v (一)通过搜索引擎查找 v (二)通过专门的生物信息学数据库目录查询 从2000 年开始,Nucleic Acids Research 设立了一个数据库目录(http:/www.oxfo

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