基因家族生信分析一、什么是基因家族概念：是来源于同一个祖先，有一个基因通过基因重复而产生两个或更多的拷贝而构成的一组基因，他们在结构和功能上具有明显的相似性，编码相似的蛋白质产物。划分：按功能划分：把一些功能类似的基因聚类，形成一个家族。按照序列相似程度划分:一般将同源的基因放在一起认为是一个家族。1. 常见基因家族：WRKY基因家族：是植物前十大蛋白质基因家族之一，大量研究表明，WRKY基因家族的许多成员参与调控植物的生长发育，形态建成与抗病虫。NBS-LRR抗病基因家族：是植物中最大类抗病基因家族之一。MADS-BOX基因家族：是植物体内的重要转录因子，它们广泛地调控着植物的生长、发育和生殖等过程。在植物中参与花器官的发育，开花时间的调节，在果实，根，茎，叶的发育中都起着重要的作用。热激蛋白70家族（HSP70）是一类在植物中高度保守的分子伴侣蛋白，在细胞中协助蛋白质正确折叠。二、基因家族分析流程：利用蛋白保守域结构提取号在Pfam数据库提取其隐马尔科夫模型矩阵文件（*.hmm） 在数据库（Ensemble、JGI、NVBI）
