1、 1计算机科学与生命科学(14)生物信息学基础2012年秋季学期通选课程上课时间:周一 18:30点 上课地点:软件园4区502d主讲人:魏天迪讲义网址:http:/ 几何形状互补;2. 分子表面电荷互补;3. 疏水作用。3蛋白质-蛋白质对接ZDOCK: http:/zdock.umassmed.edu/GRAMM-X: http:/vakser.bioinformatics.ku.edu/resources/gramm/grammx输出值可用VMD查看。保存某一个状态:在VMD main中选中当前的文件,右键Delete Frames,删去不要的那些状态,再右键Save Coordinate
2、s,保存刚才没删的状态。4蛋白质相互作用分析软件PISA: http:/www.ebi.ac.uk/msd-srv/prot_int/pistart.html注意,输入的复合体应为一个PDB文件,其中不同的单体表示为不同的CHAIN。Google: PDBe PISA5分子动力学模拟软件NAMD: http:/www.ks.uiuc.edu/Research/namd/这个软件使用起来十分复杂, 。要学 使用 要 一个 的 。6新 药 研 发 简 介济南天鸣生物科技有限公司7生命的 机物质蛋白质 8物 点蛋白质物 点蛋白质 与 人 相, 可currency1“ 的蛋白质分子。通物分子与 蛋白的合,fi可fl 的。要 某 的 物,前fi 的 点蛋白质。人体中” 10蛋白质,其中在的物 点蛋白 计在8个 右,这其中三间的1,为 点蛋白的500。9物 点蛋白质的人体的蛋白质相互作用形复杂的网 。一个蛋白质对 作用,要与其 分子相互作用, 。对 作用,要 。这 的蛋白质 点蛋白质( 点/ 点)。 对某一 的 点蛋白 要 期 的生 生 。物分子 点蛋白质 与 间不 一一对应的。10物 点蛋白质