实验四基于CLUSTAL算法的多重序列比对分析1.CLUSTAL简介CLUSTAL是对核苷酸或蛋白质进行多序列比对的程序，也可以对来自不同物种的功能相同或相似的序列进行比对和聚类，通过构建系统发生树判断亲缘关系，并对序列在生物进化过程中的保守性进行估计。CLUSTAL有CLUSTALX和CLUSTALW之分，CLUSTALW是以命令行格式运行，CLUSTALX则通过窗口格式进行操作。目前最新版本为CLUSTAL1.83，均可以从ftp:/ftp.ebi.ac.uk/pub/software/下载这里我们主要介绍CLUSTALW，从ftp直接下载DOS文件夹下的CLUSTALW到本地磁盘解压，其中有两个exe文件，CLUSTALW.exe是进行多序列比对和生成亲缘树的程序，而njplotWIN95则是对CLUSTALW.exe运行结果进行察看的程序。另外还有许多在线的ClustalW月服务，例如：http:/www.ebi.ac.uk/Clustalw/2.本地运行ClustalWClustalW程序能自动识别输入的序列，通常当读入的序列字母85%以上为A、C
