1、1ZYY制作顾 健 人上海市肿瘤研究所癌基因及相关基因国家重点实验室2ZYY制作1. 现有“生物信息学”的限制:“有眼不识泰山” 第一外显子 识别能力外显子内含子 识别能力2. 一个基因:不同剪切体 Splicing form (Isoform)3. 一个基因 蛋白质 切割:蛋白质 1肽段人基因组计划已经给了我们多少?人基因有多少个? 10万 3万?3ZYY制作4. 同一个蛋白质细胞内的不同 “定位” 不同功能!5. 98 DNA序列:功能不明 !(95)细胞核 细胞质 线粒体细胞膜蛋白质移位 Translocation4ZYY制作E1 E1 Exon 2 Exon 3p16 Ink 4a P
2、14 ARF (human)P19 ARF (mouse)Cross Talk betweren Oncogenes & tumor suppressorsOncogenic SignalsRas, c-myc, E2Fp16 Ink 4a Rbon Cell cyclearrestP14 ARF (Block MDM-2 / p53 binding)p53 on DNADamage一个基因可编编码两种完全不同的蛋白质5ZYY制作功能基因组学 Functional Genomics阐明基因(蛋白质)之间的相互作用 与生命活动的关系 与疾病的关系 与环境、药物的关系基因组测序只是基因组研究的起点
3、“功能基因组学”的含义被“局限地”误解“基因表达谱”的误解或局限性cDNA芯片:mRNA表达蛋白质表达蛋白质芯片:只知道蛋白质的表达与存在并不知道蛋白质的功能状态问题:在基因组的水平6ZYY制作1. 糖基化 (1) 膜表面蛋白:影响细胞识别,细胞细胞相互关系(2) 细胞表面抗原:(3) 细胞内蛋白:特定糖基化与蛋白质叠成为高级结构有关成熟蛋白质不成熟蛋白质的“质控”表志2. 乙酰化: 组蛋白:与DNA结合能力、复制、转录其它蛋白质 (如p53)3. 磷酸化:4. 蛋白质切割成片段:一个蛋白质多种功能。7ZYY制作细胞分子细胞生物学重要问题: 性 (内 细胞、平 细胞)细胞 : 病 性 病“ T
4、o be or not to be, thats a question”HamletShakespear细胞增殖细胞凋亡生 8ZYY制作细胞凋亡基因Apoptotic gene原癌 基因Proto- oncogene抑癌 基因CancerSuppressorDNA复制基因细胞周期基因DNA转录(抗凋亡)Antiapoptotic (促进凋亡)MCheck Points of Cell CycleG1 S check pointG2 M check pointM: Mitotic Spindle checkpoint9ZYY制作分子 细胞 组织 机体误 :相互分离。每种疾病均集中于反映出疾病的细胞:集中在癌细胞误 :忽视癌细胞以外的细胞疾病: 心脏病 心肌细胞 心肌间质血管内皮细胞高血压 内皮细胞 内皮细胞间质细胞炎症细胞 平滑肌细胞 性疾病: 神经原细胞 神经原胶质细胞间质内皮细胞(高血压脑病)10ZYY制作间质细胞内 细胞 内 细胞细胞细胞状细胞 Dendritic cellCytokine (细胞因子) Cytokine Receptor 细胞因子体Chemokine(化因子) Chemokine Receptor化因子体恶性肿瘤currency1 细胞外“有的细胞: