福建农林大学生物信息学复习材料.doc

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资源描述

概念生物信息学 狭义:分子生物信息学,用信息技术存储、分析基因组、蛋白质组序列。 广义:指生物科学与信息科学与计算机科学、物理学、化学交汇融合的交叉学科。 信息:指能够消除人们不确定性的东西 。信息可以计算Score:衡量匹配结果的质量,是相对的(与选取的计分依据有关),越高越好E值:expectation value 评估相似性,是绝对的,越低越好P值:P 0 表示越显著结果越可信,P 结果随机产生的可能性越大) 是指获得至少与两条无关序列间的偶然相似性一样高的分值的概率,低P值表明重要的匹配,这些匹配可能会有生物学意义重复序列:真核生物的基因组中具有多数反复存在的DNA 顺序组成(一般不参与编码) 用Repeatmasker软件查找重复序列序列谱:由多序列对比结果的全部信息构造的序列特征表,表中列出每一个位点氨基酸残基的替代.插入,缺失等情况双序列比对:通过一定的算法对两个DNA或蛋白质的序列进行比较,找出两者之间最大相似性的方法。 工具是用程序来编写完成算法。记分矩阵:为了反映两个序

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