生物信息学蛋白质结构分析与预测1、说出至少一种蛋白质结构数据库和一种可视化工具。蛋白质结构数据的获取-PDB库。蛋白质三维结构显示比较出名的有：RASMOL，Swiss-PDBViewer和VMD等，Rasmol：是最著名的大分子结构可视化工具之一(Rasmol -3EBJ)。2、蛋白质结构的分析包括哪些？ 结构品质的分析； 蛋白质内部相互作用分析； 溶剂可接近表面的计算及分析； 功能位点的分析。3、蛋白质结构联配的概念。蛋白质结构联配（比对）：将两个相似的三维结构尽可能重叠在一起，这样使得结构上对应残基的主链原子在空间尽可能的靠近。利用重叠反过来定义序列的联配，通常认为序列上匹配的残基在空间距离上是相近的。通过结构联配找到同源关系更远的蛋白质，因为结构要比序列更加保守。4、说出一种结构相似性搜索工具。NCBIVAST search使用举例。5、说出两个蛋白质结构分类数据，说出几种结构类。结构分类主要依据：序列比对和结构比对。分类方法：分层分类方法（树状结构）。折叠子tim桶，超家族，同源体，相似体。结构分类数
