拟南芥和水稻转录因子WRKY的同义密码子使用偏好性分析生物科学 2004级 何瑞指导老师 刘汉梅 讲 师摘要：本文首次对拟南芥和水稻WRKY基因家族的密码子用法进行了分析，发现两个物种WRKY基因的碱基组成明显不同，水稻的密码子在第一、二、三位GC含量都明显高于拟南芥，且第三位差异最大。不同物种的WRKY基因存在共同的进化趋势，即基因GC3s逐步增大。对应性分析结果显示，拟南芥WRKY基因的密码子使用偏性受碱基组成等多种因素共同作用，水稻主要受碱基组成和基因表达水平两个因素的影响。最后确定了拟南芥和水稻WRKY基因家族的最优密码子，分别为11个和27个。研究结果为深入开展其进化、表达调控机制和提高该基因家族新成员预测的准确性等提供了重要的理论依据。关键词：WRKY基因，密码字偏好性，GC含量，EncSynonymous Codon Bias of WRKY Gene Family in Aribidopsis and RiceHE Rui Biological Science,Grade 2004Directed by LIU Han-mei
