BLAST相似序列的数据库搜索.doc

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实习 4 : BLAST相似序列的数据库搜索 学号 20090* 姓名 * 专业年级 生命生技* 实验时间 2012.6.19 提交报告时间 2012.6.20 实验目的:学习使用BLAST在数据库中搜索相似序列实验内容:使用NCBI上面的BLAST程序进行相似性序列搜索:1. 把核酸序列利用BLASTN搜索相似核酸序列;2. 把蛋白质序列对应的蛋白质利用BLASTP搜索相似蛋白质序列;3. 把核酸序列利用BLAST搜索相似蛋白质序列并与BLASTP比较,体会差异:4. 把蛋白质序列利用TBLASTN搜索相似核酸序列并与BLASTN比较,体会差异:5. 把核酸序列利用TBLASTX搜索相似核酸序列并与BLASTN比较,体会差异。作业:1. 找一条你感兴趣的核酸序列(可以是前面搜索到的同源核酸序列中任意一条),通过BLASTN搜索NR数据库,说明你的参数如何设置,分析搜索结果包含哪些信息。答:使用的序列为:智人胰岛素(INS)gi|ref

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