如何读懂一份NGS检测报告临床应用时,我们常会有诸多疑问 需要用多大的panel? 需要测多深? 多少灵敏度就是足够? 如何理解突变丰度? 如何理解多突变并存? 哪个是主克隆?亚克隆?如何用药? 在哪些情况下,NGS“测不准”? 样本质量与污染的干扰 TMB检测的局限性(来自样本的LoD限制)选择好的NGS检测如何读懂NGS的有效信息NGS应用的局限性读懂NGS报告,你首先需要知道报告核心信息有哪些?核心结构Summary小结体细胞突变 对应有何药物?胚系突变 遗传风险?TMB/MSI等结果 免疫治疗获益?质控 样本是否符合要求1:总体小结信息提取临床信息:肺癌,血浆样本l 有临床意义变异:NTRK基因融合l 肿瘤突变负荷:7.9个突变/Mbl 胚系致病变异:无l 样本质量评估:合格2:体细胞变异及解读体细胞变异及解读l 基因变异形式l 突变丰度l 靶向药物及证据级别:A?B?C?D?突变丰度怎么定义?(组织)Wild type 野生型 = “G”Mutation 突变型 = “A”Allele Fraction(AF) = “A” / total depth突变丰度 = 测到A的次数