药物和生物活性小分子发现和分子设计课件.ppt

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资料仅供参考,不当之处,请联系改正。3124SwissTargetPredictionDDI-CPISEPPA 2.0ProTox5总结与展望资料仅供参考,不当之处,请联系改正。SwissTargetPrediction映射活性小分子的目标分子可以预测潜在机理和副作用用于生物活性小分子靶点预测生物活性小分子连接到蛋白或者大尺寸目标分子来调节生物活性:资料仅供参考,不当之处,请联系改正。SwissTargetPrediction用于生物活性小分子靶点预测 特点:结合2D和3D相似性测量;预测可针对五个不同生命体;数据集包括280381个小分子与2686个目标相互作用,其中66的目标是人类的;资料仅供参考,不当之处,请联系改正。 3D相似性计算: 18维特征实数向量: 每个分子通过ChemAxonmolconvert 工具生成20 个同分异构体; 超过20 个时,选择能量最低的构象;不足20 个时,则选择全部构象; Manhattan距离: 构象x和y特征的曼哈顿距离计算公式: 最终的3D 相似值计算公式: dij是2020 组里最小曼哈顿距离,所以s1是其中最大值。SwissTarget

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