生物大分子的计算机模拟生物大分子的计算机模拟n n 生物大分子的计算机模拟方法n n 蛋白质三维结构的模建n n 核酸结构的模拟生物大分子的计算机模拟方法n n 量子力学n n 分子力学n n 分子动力学量子力学n n 量子力学是微观世界物质运动的普遍规律n n 一个分子体系的状态可以用Schrodinger 方程来表示，通过求解Schrodinger 方程可以得到分子体系的结构和性质n n 量子力学方法的特点：n n计算结果精确度高，限于计算机的计算能力，计算结果精确度高，限于计算机的计算能力，能够计算的体系小能够计算的体系小n n从头计算方法：从头计算方法：100100个原子；半经验计算：个原子；半经验计算：1000-10,0001000-10,000个个n n目前，生物大分子体系还不能用量子力学方法目前，生物大分子体系还不能用量子力学方法模拟模拟分子力学n n 分子力学是一种近似处理方法 n n忽略电子的运动，将体系的势能看作是原子核忽略电子的运动，将体系的势能看作是原子核位置的函数位置的函数n n 力场：分子体系的势能函数 n n分子的势能分子的势能 = = 键伸缩能键伸缩能
