蛋白质学组中质谱数据定量分析方法研究谢红卫国防科学技术大学机电工程与自动化学院自动控制系2010.5.151主要内容 研究背景(我们对定量问题的认识) 定量数据分析面对的问题 定量数据分析的基本方法 已有定量软件和应用情况 研究内容和结果 定量信息提取方法及问题 多批次定量数据的对应及重复实验 差异显著性检验 计算问题和软件开发 未来工作2第一部分:研究背景3定量数据分析面对的问题 大规模Biomarker 发现-低丰度蛋白质- 信号S/N低+鉴定信息少 重复实验数据综合 蛋白质和肽段预分离技术策略的数据综合 Biomarker验证-靶标分析- 靶标挑选(MRM)肽段分析效率预测(绝对定量)生物样本蛋白质表达的随机变化影响 临床诊断-直接寻找差异- 肽段组学,肽段特征矩阵,LC-MS策略,信号直接对比+有选择鉴定4定量数据分析的基本方法不包括MRM、iTRAQ和SC定量标记定量无标定量5计算问题 图谱定量信息提取-同位素峰簇处理 肽段定量指标计算-比值计算,XIC处理,母离子误差校正 RT对齐-LC-MS策略和LC-MS/MS策略的不同 信号归一化-消除系统误差 差异显著性检验-考虑信