分子力学和分子动力学Molecular Mechanics and Molecular Dynamics 甄云梅20111210内容n 简介n 力场 1.分子力场的势函数形式 2.分子力场分类 3.力场的参数化n 能量最小化n 热力学性质分子力学-简介n 分子力学,又叫力场方法( force field method),是基于经典牛顿力学方程的一种计算分子的平衡结构和能量的方法。与量子力学不同,它求解的是Newton方程,而不是薛定谔方程。n 基本假设:p 1、 The Born-Oppenheimer Approximation对势能面的经验性拟合。 量子力学中的薛定谔方程为:(非相对论和无时间依赖的情况下) 体系的哈密顿算符与原子核(R)和电子(r)位置相关的波函数分子力学-简介l 基于Born-Oppenheimer近似,其物理模型可描述为:原子核的质量是电子质量的103105倍,电子速度远远大于原子核的运动速度,每当核的分布形式发生微小变更,电子立刻调整其运动状态以适应新的核场。l 这意味着,在任一确定的核分布形式下,电子都有相应的运动状态;同时核间的相对运动可视为所有电子运动