基因组序列诠释ppt课件.ppt

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资源描述

问题 基因组序列所包含的全部遗传信息是什么? 基因组作为一个整体如何行使其功能? 用什么方法寻找基因、研究基因的功能呢?1. 寻找基因1.1 根据开放读码框预测基因A A 起始密码子起始密码子 ATGATG第一个第一个ATGATG的确定的确定(依据依据KozakKozak规则规则);); Kozak Kozak规则是基于已知数据的统计结果规则是基于已知数据的统计结果. 所谓所谓KozakKozak规则,即第一个规则,即第一个ATGATG侧翼序列的碱侧翼序列的碱基分布所满足的统计规律基分布所满足的统计规律.Kozak 规则: 若将第一个若将第一个ATGATG中的碱基中的碱基AA,TT,GG分别分别标为标为11,22,33位,则位,则KozakKozak规则可描述如下:规则可描述如下:(1) (1) 第第44位的偏好碱基为位的偏好碱基为GG;(2) ATG(2) ATG的的55端约端约15bp15bp范围的侧翼序列内不含碱范围的侧翼序列内不含碱基基TT;(3) (3) 在在-3-3,-6-6和和-9-9位置,位置,GG是偏好碱基;是偏好碱基;(4) (4) 除除-3-3,-6-6和和-9-

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